Detalles de la búsqueda
1.
Latent feature extraction with a prior-based self-attention framework for spatial transcriptomics.
Genome Res
; 33(10): 1757-1773, 2023 10.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37903634
2.
RefTM: reference-guided topic modeling of single-cell chromatin accessibility data.
Brief Bioinform
; 24(1)2023 01 19.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36513377
3.
Cofea: correlation-based feature selection for single-cell chromatin accessibility data.
Brief Bioinform
; 25(1)2023 11 22.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38113078
4.
scPRAM accurately predicts single-cell gene expression perturbation response based on attention mechanism.
Bioinformatics
; 40(5)2024 May 02.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38625746
5.
EpiCarousel: memory- and time-efficient identification of metacells for atlas-level single-cell chromatin accessibility data.
Bioinformatics
; 40(4)2024 Mar 29.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38588573
6.
ASTER: accurately estimating the number of cell types in single-cell chromatin accessibility data.
Bioinformatics
; 39(1)2023 01 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36610708
7.
simCAS: an embedding-based method for simulating single-cell chromatin accessibility sequencing data.
Bioinformatics
; 39(8)2023 08 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37494428
8.
SilencerDB: a comprehensive database of silencers.
Nucleic Acids Res
; 49(D1): D221-D228, 2021 01 08.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33045745
9.
OpenAnnotate: a web server to annotate the chromatin accessibility of genomic regions.
Nucleic Acids Res
; 49(W1): W483-W490, 2021 07 02.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33999180
10.
Sex-dependent expression of N-cadherin-GluA1 pathway-related molecules in the prefrontal cortex mediates anxiety-like behavior in male offspring following prenatal stress.
Stress
; 24(5): 612-620, 2021 09.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34184955
11.
EnClaSC: a novel ensemble approach for accurate and robust cell-type classification of single-cell transcriptomes.
BMC Bioinformatics
; 21(Suppl 13): 392, 2020 Sep 17.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32938367
12.
The combination therapy with esomeprazole and flupenthixol/melitracen in symptom improvement of erosive gastritis complicated with negative feelings compared with Esomeprazole alone.
Cell Mol Biol (Noisy-le-grand)
; 66(5): 15-19, 2020 Jul 31.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33040806
13.
VPAC: Variational projection for accurate clustering of single-cell transcriptomic data.
BMC Bioinformatics
; 20(Suppl 7): 0, 2019 May 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31074382
14.
Predicting enhancers with deep convolutional neural networks.
BMC Bioinformatics
; 18(Suppl 13): 478, 2017 Dec 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29219068
15.
OpenAnnotateApi: Python and R packages to efficiently annotate and analyze chromatin accessibility of genomic regions.
Bioinform Adv
; 4(1): vbae055, 2024.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38645715
16.
Accurate Annotation for Differentiating and Imbalanced Cell Types in Single-cell Chromatin Accessibility Data.
IEEE/ACM Trans Comput Biol Bioinform
; PP2024 Mar 05.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38442065
17.
Discrete latent embedding of single-cell chromatin accessibility sequencing data for uncovering cell heterogeneity.
Nat Comput Sci
; 2024 May 10.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38730185
18.
scButterfly: a versatile single-cell cross-modality translation method via dual-aligned variational autoencoders.
Nat Commun
; 15(1): 2973, 2024 Apr 06.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38582890
19.
scCASE: accurate and interpretable enhancement for single-cell chromatin accessibility sequencing data.
Nat Commun
; 15(1): 1629, 2024 Feb 22.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38388573
20.
scIBD: a self-supervised iterative-optimizing model for boosting the detection of heterotypic doublets in single-cell chromatin accessibility data.
Genome Biol
; 24(1): 225, 2023 10 09.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37814314