Detalles de la búsqueda
1.
Detection of persistent organic pollutants binding modes with androgen receptor ligand binding domain by docking and molecular dynamics.
BMC Struct Biol
; 13: 16, 2013 Sep 22.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-24053684
2.
Identification of key residues for protein conformational transition using elastic network model.
J Chem Phys
; 135(17): 174101, 2011 Nov 07.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-22070286
3.
Role of electrostatic interactions for the stability and folding behavior of cold shock protein.
Proteins
; 78(9): 2157-69, 2010 Jul.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-20455270
4.
Protein unfolding behavior studied by elastic network model.
Biophys J
; 94(12): 4586-96, 2008 Jun.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-18310247
5.
Amino acid network and its scoring application in protein-protein docking.
Biophys Chem
; 134(3): 111-8, 2008 May.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-18329160
6.
Study on the molecular mechanism of inhibiting HIV-1 integrase by EBR28 peptide via molecular modeling approach.
Biophys Chem
; 132(2-3): 69-80, 2008 Feb.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-18037557
7.
A novel high-throughput format assay for HIV-1 integrase strand transfer reaction using magnetic beads.
Acta Pharmacol Sin
; 29(3): 397-404, 2008 Mar.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-18298906
8.
Evolving model of amino acid networks.
Phys Rev E Stat Nonlin Soft Matter Phys
; 77(6 Pt 1): 061920, 2008 Jun.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-18643313
9.
Prediction of the binding mode between BMS-378806 and HIV-1 gp120 by docking and molecular dynamics simulation.
Biochim Biophys Acta
; 1764(4): 766-72, 2006 Apr.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-16455315
10.
A filter enhanced sampling and combinatorial scoring study for protein docking in CAPRI.
Proteins
; 69(4): 859-65, 2007 Dec 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-17803223
11.
Complex-type-dependent scoring functions in protein-protein docking.
Biophys Chem
; 129(1): 1-10, 2007 Aug.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-17540496
12.
Construction and application of the weighted amino acid network based on energy.
Phys Rev E Stat Nonlin Soft Matter Phys
; 75(5 Pt 1): 051903, 2007 May.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-17677094
13.
Biologically enhanced sampling geometric docking and backbone flexibility treatment with multiconformational superposition.
Proteins
; 60(2): 319-23, 2005 Aug 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-15981260
14.
A soft docking algorithm for predicting the structure of antibody-antigen complexes.
Proteins
; 52(1): 47-50, 2003 Jul 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-12784367
15.
Protein molecular dynamics with electrostatic force entirely determined by a single Poisson-Boltzmann calculation.
Proteins
; 48(3): 497-504, 2002 Aug 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-12112674
16.
A soft docking algorithm for predicting the structures of protein-protein complexes.
Sheng Wu Hua Xue Yu Sheng Wu Wu Li Xue Bao (Shanghai)
; 35(1): 35-40, 2003 Jan.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-12518225
17.
Identification of functionally key residues in AMPA receptor with a thermodynamic method.
J Phys Chem B
; 117(29): 8689-96, 2013 Jul 25.
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| MEDLINE | ID: mdl-23822189
18.
An analysis of the influence of protein intrinsic dynamical properties on its thermal unfolding behavior.
J Biomol Struct Dyn
; 29(1): 105-21, 2011 Aug.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-21696228
19.
Insight into the inhibitory mechanism and binding mode between D77 and HIV-1 integrase by molecular modeling methods.
J Biomol Struct Dyn
; 29(2): 311-23, 2011 Oct.
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| MEDLINE | ID: mdl-21875151
20.
Study on the inhibitory mechanism and binding mode of the hydroxycoumarin compound NSC158393 to HIV-1 integrase by molecular modeling.
Biopolymers
; 91(9): 700-9, 2009 Sep.
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| MEDLINE | ID: mdl-19382173