Detalles de la búsqueda
1.
Repression and 3D-restructuring resolves regulatory conflicts in evolutionarily rearranged genomes.
Cell
; 185(20): 3689-3704.e21, 2022 09 29.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36179666
2.
RNA-mediated symmetry breaking enables singular olfactory receptor choice.
Nature
; 625(7993): 181-188, 2024 Jan.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38123679
3.
Cell-type specialization is encoded by specific chromatin topologies.
Nature
; 599(7886): 684-691, 2021 11.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34789882
4.
Multiplex-GAM: genome-wide identification of chromatin contacts yields insights overlooked by Hi-C.
Nat Methods
; 20(7): 1037-1047, 2023 07.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37336949
5.
Comparison of the Hi-C, GAM and SPRITE methods using polymer models of chromatin.
Nat Methods
; 18(5): 482-490, 2021 05.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33963348
6.
8-oxodG accumulation within super-enhancers marks fragile CTCF-mediated chromatin loops.
Nucleic Acids Res
; 50(6): 3292-3306, 2022 04 08.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35234932
7.
Hmga2 protein loss alters nuclear envelope and 3D chromatin structure.
BMC Biol
; 20(1): 171, 2022 08 02.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35918713
8.
Preformed chromatin topology assists transcriptional robustness of Shh during limb development.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 116(25): 12390-12399, 2019 06 18.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31147463
9.
Further Delineation of Duplications of ARX Locus Detected in Male Patients with Varying Degrees of Intellectual Disability.
Int J Mol Sci
; 23(6)2022 Mar 13.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35328505
10.
Polymer models are a versatile tool to study chromatin 3D organization.
Biochem Soc Trans
; 49(4): 1675-1684, 2021 08 27.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34282837
11.
Inference of chromosome 3D structures from GAM data by a physics computational approach.
Methods
; 181-182: 70-79, 2020 10 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31604121
12.
The Interplay between Phase Separation and Gene-Enhancer Communication: A Theoretical Study.
Biophys J
; 119(4): 873-883, 2020 08 18.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32738219
13.
Publisher Correction: Comparison of the Hi-C, GAM and SPRITE methods using polymer models of chromatin.
Nat Methods
; 18(10): 1266, 2021 Oct.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34480161
14.
Molecular Dynamics simulations of the Strings and Binders Switch model of chromatin.
Methods
; 142: 81-88, 2018 06 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29522804
15.
Predicting chromatin architecture from models of polymer physics.
Chromosome Res
; 25(1): 25-34, 2017 03.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28070687
16.
Hierarchical folding and reorganization of chromosomes are linked to transcriptional changes in cellular differentiation.
Mol Syst Biol
; 11(12): 852, 2015 Dec 23.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-26700852
17.
Multiscale modelling of chromatin 4D organization in SARS-CoV-2 infected cells.
Nat Commun
; 15(1): 4014, 2024 May 13.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38740770
18.
A single dose of cocaine rewires the 3D genome structure of midbrain dopamine neurons.
bioRxiv
; 2024 May 12.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38766140
19.
Phase separation of ecDNA aggregates establishes in-trans contact domains boosting selective MYC regulatory interactions.
bioRxiv
; 2023 Jul 17.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37503084
20.
Physics-Based Polymer Models to Probe Chromosome Structure in Single Molecules.
Methods Mol Biol
; 2655: 57-66, 2023.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37212988