Detalles de la búsqueda
1.
RNA-Bloom enables reference-free and reference-guided sequence assembly for single-cell transcriptomes.
Genome Res
; 30(8): 1191-1200, 2020 08.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32817073
2.
Mismatch-tolerant, alignment-free sequence classification using multiple spaced seeds and multiindex Bloom filters.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 117(29): 16961-16968, 2020 07 21.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32641514
3.
Fusion-Bloom: fusion detection in assembled transcriptomes.
Bioinformatics
; 36(7): 2256-2257, 2020 04 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31790154
4.
Recurrent tumor-specific regulation of alternative polyadenylation of cancer-related genes.
BMC Genomics
; 19(1): 536, 2018 Jul 13.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30005633
5.
Subgroup-specific structural variation across 1,000 medulloblastoma genomes.
Nature
; 488(7409): 49-56, 2012 Aug 02.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-22832581
6.
Frequent mutation of histone-modifying genes in non-Hodgkin lymphoma.
Nature
; 476(7360): 298-303, 2011 Jul 27.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-21796119
7.
Improved white spruce (Picea glauca) genome assemblies and annotation of large gene families of conifer terpenoid and phenolic defense metabolism.
Plant J
; 83(2): 189-212, 2015 Jul.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-26017574
8.
Genomic and epigenomic landscapes of adult de novo acute myeloid leukemia.
N Engl J Med
; 368(22): 2059-74, 2013 05 30.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-23634996
9.
Mutational and structural analysis of diffuse large B-cell lymphoma using whole-genome sequencing.
Blood
; 122(7): 1256-65, 2013 Aug 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-23699601
10.
Obligate biotrophy features unraveled by the genomic analysis of rust fungi.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 108(22): 9166-71, 2011 May 31.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-21536894
11.
Barnacle: detecting and characterizing tandem duplications and fusions in transcriptome assemblies.
BMC Genomics
; 14: 550, 2013 Aug 14.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-23941359
12.
De novo assembly and analysis of RNA-seq data.
Nat Methods
; 7(11): 909-12, 2010 Nov.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-20935650
13.
Concurrent CIC mutations, IDH mutations, and 1p/19q loss distinguish oligodendrogliomas from other cancers.
J Pathol
; 226(1): 7-16, 2012 Jan.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-22072542
14.
Reference-free assembly of long-read transcriptome sequencing data with RNA-Bloom2.
Nat Commun
; 14(1): 2940, 2023 05 22.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37217540
15.
Linked-read sequencing for detecting short tandem repeat expansions.
Sci Rep
; 12(1): 9352, 2022 06 07.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35672336
16.
Straglr: discovering and genotyping tandem repeat expansions using whole genome long-read sequences.
Genome Biol
; 22(1): 224, 2021 08 13.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34389037
17.
Genome-wide sequencing as a first-tier screening test for short tandem repeat expansions.
Genome Med
; 13(1): 126, 2021 08 09.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34372915
18.
A clinical transcriptome approach to patient stratification and therapy selection in acute myeloid leukemia.
Nat Commun
; 12(1): 2474, 2021 04 30.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33931648
19.
Base excision repair deficiency signatures implicate germline and somatic MUTYH aberrations in pancreatic ductal adenocarcinoma and breast cancer oncogenesis.
Cold Spring Harb Mol Case Stud
; 5(2)2019 04.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30833417
20.
TAP: a targeted clinical genomics pipeline for detecting transcript variants using RNA-seq data.
BMC Med Genomics
; 11(1): 79, 2018 Sep 10.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-30200994