Detalles de la búsqueda
1.
DoubleHelix: nucleic acid sequence identification, assignment and validation tool for cryo-EM and crystal structure models.
Nucleic Acids Res
; 51(15): 8255-8269, 2023 08 25.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37395405
2.
Cryo-EM model validation recommendations based on outcomes of the 2019 EMDataResource challenge.
Nat Methods
; 18(2): 156-164, 2021 02.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33542514
3.
AlphaPulldown-a python package for protein-protein interaction screens using AlphaFold-Multimer.
Bioinformatics
; 39(1)2023 01 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36413069
4.
RNA 3D structure modeling by fragment assembly with small-angle X-ray scattering restraints.
Bioinformatics
; 39(9)2023 09 02.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37647627
5.
Asymmetric horseshoe-like assembly of peroxisomal yeast oxalyl-CoA synthetase.
Biol Chem
; 404(2-3): 195-207, 2023 02 23.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36694962
6.
Structural studies of RNA-protein complexes: A hybrid approach involving hydrodynamics, scattering, and computational methods.
Methods
; 118-119: 146-162, 2017 04 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-27939506
7.
RNA-Puzzles Round II: assessment of RNA structure prediction programs applied to three large RNA structures.
RNA
; 21(6): 1066-84, 2015 Jun.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-25883046
8.
Sequence-specific cleavage of dsRNA by Mini-III RNase.
Nucleic Acids Res
; 43(5): 2864-73, 2015 Mar 11.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-25634891
9.
RNA Bricks--a database of RNA 3D motifs and their interactions.
Nucleic Acids Res
; 42(Database issue): D123-31, 2014 Jan.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-24220091
10.
ClaRNA: a classifier of contacts in RNA 3D structures based on a comparative analysis of various classification schemes.
Nucleic Acids Res
; 42(19): e151, 2014 Oct 29.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-25159614
11.
Characterization of the termini of the West Nile virus genome and their interactions with the small isoform of the 2' 5'-oligoadenylate synthetase family.
J Struct Biol
; 190(2): 236-49, 2015 May.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-25871524
12.
Brickworx builds recurrent RNA and DNA structural motifs into medium- and low-resolution electron-density maps.
Acta Crystallogr D Biol Crystallogr
; 71(Pt 3): 697-705, 2015 Mar.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-25760616
13.
Computational modeling of protein-RNA complex structures.
Methods
; 65(3): 310-9, 2014 Feb.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-24083976
14.
Solution conformation of adenovirus virus associated RNA-I and its interaction with PKR.
J Struct Biol
; 185(1): 48-57, 2014 Jan.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-24291322
15.
Computational modeling of RNA 3D structures, with the aid of experimental restraints.
RNA Biol
; 11(5): 522-36, 2014.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-24785264
16.
Outcomes of the EMDataResource Cryo-EM Ligand Modeling Challenge.
Res Sq
; 2024 Jan 25.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38343795
17.
RIBER/DIBER: a software suite for crystal content analysis in the studies of protein-nucleic acid complexes.
Bioinformatics
; 28(6): 880-1, 2012 Mar 15.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-22238259
18.
Sequence-assignment validation in protein crystal structure models with checkMySequence.
Acta Crystallogr D Struct Biol
; 79(Pt 7): 559-568, 2023 Jul 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37314404
19.
Predicted models and CCP4.
Acta Crystallogr D Struct Biol
; 79(Pt 9): 806-819, 2023 Sep 01.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-37594303
20.
The CCP4 suite: integrative software for macromolecular crystallography.
Acta Crystallogr D Struct Biol
; 79(Pt 6): 449-461, 2023 Jun 01.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-37259835