Detalles de la búsqueda
1.
A Single-Cell Transcriptome Atlas of the Aging Drosophila Brain.
Cell
; 174(4): 982-998.e20, 2018 08 09.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29909982
2.
Cell-type-directed design of synthetic enhancers.
Nature
; 626(7997): 212-220, 2024 Feb.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38086419
3.
Decoding gene regulation in the fly brain.
Nature
; 601(7894): 630-636, 2022 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34987221
4.
SCENIC+: single-cell multiomic inference of enhancers and gene regulatory networks.
Nat Methods
; 20(9): 1355-1367, 2023 09.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37443338
5.
Interpretation of allele-specific chromatin accessibility using cell state-aware deep learning.
Genome Res
; 31(6): 1082-1096, 2021 06.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33832990
6.
Cross-species analysis of enhancer logic using deep learning.
Genome Res
; 30(12): 1815-1834, 2020 12.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32732264
7.
cisTopic: cis-regulatory topic modeling on single-cell ATAC-seq data.
Nat Methods
; 16(5): 397-400, 2019 05.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30962623
8.
Identification of genomic enhancers through spatial integration of single-cell transcriptomics and epigenomics.
Mol Syst Biol
; 16(5): e9438, 2020 05.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32431014
9.
Multiplex enhancer-reporter assays uncover unsophisticated TP53 enhancer logic.
Genome Res
; 26(7): 882-95, 2016 07.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-27197205
10.
Discovery of transcription factors and regulatory regions driving in vivo tumor development by ATAC-seq and FAIRE-seq open chromatin profiling.
PLoS Genet
; 11(2): e1004994, 2015 Feb.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-25679813
11.
Identification of Lineage-Specific Cis-Regulatory Modules Associated with Variation in Transcription Factor Binding and Chromatin Activity Using Ornstein-Uhlenbeck Models.
Mol Biol Evol
; 32(9): 2441-55, 2015 Sep.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-25944915
12.
Comparative motif discovery combined with comparative transcriptomics yields accurate targetome and enhancer predictions.
Genome Res
; 23(1): 74-88, 2013 Jan.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-23070853
13.
iRegulon: from a gene list to a gene regulatory network using large motif and track collections.
PLoS Comput Biol
; 10(7): e1003731, 2014 Jul.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-25058159
14.
Single-cell spatial multi-omics and deep learning dissect enhancer-driven gene regulatory networks in liver zonation.
Nat Cell Biol
; 26(1): 153-167, 2024 Jan.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38182825
15.
CD36 promotes adipocyte differentiation and adipogenesis.
Biochim Biophys Acta
; 1820(7): 949-56, 2012 Jul.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-22507268
16.
Shared enhancer gene regulatory networks between wound and oncogenic programs.
Elife
; 122023 05 03.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37133250
17.
Systematic benchmarking of single-cell ATAC-sequencing protocols.
Nat Biotechnol
; 2023 Aug 03.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37537502
18.
Hydrop enables droplet-based single-cell ATAC-seq and single-cell RNA-seq using dissolvable hydrogel beads.
Elife
; 112022 02 23.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35195064
19.
Growth arrest-specific protein 6 receptor antagonism impairs adipocyte differentiation and adipose tissue development in mice.
J Pharmacol Exp Ther
; 337(2): 457-64, 2011 May.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-21285281
20.
Analysis of long and short enhancers in melanoma cell states.
Elife
; 102021 12 07.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-34874265