Detalles de la búsqueda
1.
Molecular basis for the initiation of DNA primer synthesis.
Nature
; 605(7911): 767-773, 2022 05.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35508653
2.
Impact of an Ionic Liquid Solution on Horseradish Peroxidase Activity.
J Am Chem Soc
; 146(19): 13247-13257, 2024 May 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38701006
3.
Effects of the Y432S Cancer-Associated Variant on the Reaction Mechanism of Human DNA Polymerase κ.
J Chem Inf Model
; 64(10): 4231-4249, 2024 May 27.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38717969
4.
Investigation of dynamical flexibility of D5SIC-DNAM inside DNA duplex in aqueous solution: a systematic classical MD approach.
Phys Chem Chem Phys
; 26(9): 7435-7445, 2024 Feb 28.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38353005
5.
Investigation of the stability of D5SIC-DNAM-incorporated DNA duplex in Taq polymerase binary system: a systematic classical MD approach.
Phys Chem Chem Phys
; 26(9): 7287-7295, 2024 Feb 28.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38353000
6.
Relative cooperativity in neutral and charged molecular clusters using QM/MM calculations.
J Chem Phys
; 160(13)2024 Apr 07.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38557841
7.
Seamless integration of GEM, a density based-force field, for QM/MM simulations via LICHEM, Psi4, and Tinker-HP.
J Chem Phys
; 160(17)2024 May 07.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38747990
8.
Distal Mutations in the ß-Clamp of DNA Polymerase III* Disrupt DNA Orientation and Affect Exonuclease Activity.
J Am Chem Soc
; 145(6): 3478-3490, 2023 02 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36745735
9.
Regioselective Direct C-H Bond Heteroarylation of Thiazoles Enabled by an Iminopyridine-Based α-Diimine Nickel(II) Complex Evaluated by DFT Studies.
J Org Chem
; 88(17): 12319-12328, 2023 Sep 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37603582
10.
Investigation of the Inhibition Mechanism of Xanthine Oxidoreductase by Oxipurinol: A Computational Study.
J Chem Inf Model
; 63(13): 4190-4206, 2023 07 10.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37319436
11.
Leveraging QM/MM and Molecular Dynamics Simulations to Decipher the Reaction Mechanism of the Cas9 HNH Domain to Investigate Off-Target Effects.
J Chem Inf Model
; 63(21): 6834-6850, 2023 11 13.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37877218
12.
Computational Investigation of a Series of Small Molecules as Potential Compounds for Lysyl Hydroxylase-2 (LH2) Inhibition.
J Chem Inf Model
; 63(3): 986-1001, 2023 02 13.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36779232
13.
AmberTools.
J Chem Inf Model
; 63(20): 6183-6191, 2023 Oct 23.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37805934
14.
Computational compensatory mutation discovery approach: Predicting a PARP1 variant rescue mutation.
Biophys J
; 121(19): 3663-3673, 2022 10 04.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35642254
15.
Impact of Remdesivir Incorporation along the Primer Strand on SARS-CoV-2 RNA-Dependent RNA Polymerase.
J Chem Inf Model
; 62(10): 2456-2465, 2022 05 23.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35435671
16.
Polarizable MD and QM/MM investigation of acrylamide-based leads to target the main protease of SARS-CoV-2.
J Chem Phys
; 157(18): 185101, 2022 Nov 14.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36379777
17.
Structural and electronic analysis of the octarepeat region of prion protein with four Cu2+ by polarizable MD and QM/MM simulations.
Phys Chem Chem Phys
; 23(38): 21568-21578, 2021 Oct 06.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34550129
18.
Computational investigations of selected enzymes from two iron and α-ketoglutarate-dependent families.
Phys Chem Chem Phys
; 23(39): 22227-22240, 2021 Oct 13.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34586107
19.
Improvement of the Gaussian Electrostatic Model by separate fitting of Coulomb and exchange-repulsion densities and implementation of a new dispersion term.
J Chem Phys
; 155(19): 194103, 2021 Nov 21.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34800949
20.
Current Status of AMOEBA-IL: A Multipolar/Polarizable Force Field for Ionic Liquids.
Int J Mol Sci
; 21(3)2020 Jan 21.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31973103