Detalles de la búsqueda
1.
msqrob2PTM: Differential Abundance and Differential Usage Analysis of MS-Based Proteomics Data at the Posttranslational Modification and Peptidoform Level.
Mol Cell Proteomics
; 23(2): 100708, 2024 Feb.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38154689
2.
Quality Control for the Target Decoy Approach for Peptide Identification.
J Proteome Res
; 22(2): 350-358, 2023 02 03.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36648107
3.
Robust Summarization and Inference in Proteome-wide Label-free Quantification.
Mol Cell Proteomics
; 19(7): 1209-1219, 2020 07.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32321741
4.
Altering the Sex Pheromone Cyclo(l-Pro-l-Pro) of the Diatom Seminavis robusta towards a Chemical Probe.
Int J Mol Sci
; 22(3)2021 Jan 21.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-33494376
5.
Daring to be differential: metabarcoding analysis of soil and plant-related microbial communities using amplicon sequence variants and operational taxonomical units.
BMC Genomics
; 21(1): 733, 2020 Oct 22.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33092529
6.
MSqRob Takes the Missing Hurdle: Uniting Intensity- and Count-Based Proteomics.
Anal Chem
; 92(9): 6278-6287, 2020 05 05.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32227882
7.
Identification of Immune-Responsive Gene 1 (IRG1) as a Target of A20.
J Proteome Res
; 17(6): 2182-2191, 2018 06 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29733654
8.
Peptide-level Robust Ridge Regression Improves Estimation, Sensitivity, and Specificity in Data-dependent Quantitative Label-free Shotgun Proteomics.
Mol Cell Proteomics
; 15(2): 657-68, 2016 Feb.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-26566788
9.
Using variant databases for variant prioritization and to detect erroneous genotype-phenotype associations.
BMC Bioinformatics
; 18(1): 535, 2017 Dec 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29191167
10.
Model-Based Classification for Digital PCR: Your Umbrella for Rain.
Anal Chem
; 89(8): 4461-4467, 2017 04 18.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28350455
11.
VirVarSeq: a low-frequency virus variant detection pipeline for Illumina sequencing using adaptive base-calling accuracy filtering.
Bioinformatics
; 31(1): 94-101, 2015 Jan 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-25178459
12.
Leaf responses to mild drought stress in natural variants of Arabidopsis.
Plant Physiol
; 167(3): 800-16, 2015 Mar.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-25604532
13.
QTL analysis of high thermotolerance with superior and downgraded parental yeast strains reveals new minor QTLs and converges on novel causative alleles involved in RNA processing.
PLoS Genet
; 9(8): e1003693, 2013.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-23966873
14.
ViVaMBC: estimating viral sequence variation in complex populations from illumina deep-sequencing data using model-based clustering.
BMC Bioinformatics
; 16: 59, 2015 Feb 22.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-25887734
15.
QQ-SNV: single nucleotide variant detection at low frequency by comparing the quality quantiles.
BMC Bioinformatics
; 16: 379, 2015 Nov 10.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-26554718
16.
Summarization vs Peptide-Based Models in Label-Free Quantitative Proteomics: Performance, Pitfalls, and Data Analysis Guidelines.
J Proteome Res
; 14(6): 2457-65, 2015 Jun 05.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-25827922
17.
Identification of novel causative genes determining the complex trait of high ethanol tolerance in yeast using pooled-segregant whole-genome sequence analysis.
Genome Res
; 22(5): 975-84, 2012 May.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-22399573
18.
Mass spectrometrists should search for all peptides, but assess only the ones they care about.
Nat Methods
; 14(7): 643-644, 2017 06 29.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-28661493
19.
unifiedWMWqPCR: the unified Wilcoxon-Mann-Whitney test for analyzing RT-qPCR data in R.
Bioinformatics
; 30(17): 2494-5, 2014 Sep 01.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-24794933
20.
Initial community evenness favours functionality under selective stress.
Nature
; 458(7238): 623-6, 2009 Apr 02.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-19270679