Detalles de la búsqueda
1.
A fast and scalable method for inferring phylogenetic networks from trees by aligning lineage taxon strings.
Genome Res
; 33(7): 1053-1060, 2023 07.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37217252
2.
Capturing diversity: Split systems and circular approximations for conservation.
J Theor Biol
; 578: 111689, 2024 02 07.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38061489
3.
Pneumococcal population dynamics: Investigating vaccine-induced changes through multiscale modelling.
PLoS Comput Biol
; 19(12): e1011755, 2023 Dec.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38153948
4.
The role of vaccine status homophily in the COVID-19 pandemic: a cross-sectional survey with modelling.
BMC Public Health
; 24(1): 472, 2024 Feb 14.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38355444
5.
Analyzing Phylogenetic Trees with a Tree Lattice Coordinate System and a Graph Polynomial.
Syst Biol
; 71(6): 1378-1390, 2022 10 12.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35169849
6.
COVID-19 endgame: From pandemic to endemic? Vaccination, reopening and evolution in low- and high-vaccinated populations.
J Theor Biol
; 559: 111368, 2023 02 21.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36436733
7.
Spatial modeling of Mycobacterium tuberculosis transmission with dyadic genetic relatedness data.
Biometrics
; 79(4): 3650-3663, 2023 12.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36745619
8.
Effective population size in simple infectious disease models.
J Math Biol
; 87(6): 80, 2023 11 06.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37926744
9.
Event-specific interventions to minimize COVID-19 transmission.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 117(50): 32038-32045, 2020 12 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33214148
10.
Long-Term Persistence of Spike Protein Antibody and Predictive Modeling of Antibody Dynamics After Infection With Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2.
Clin Infect Dis
; 74(7): 1220-1229, 2022 04 09.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34218284
11.
Cov2clusters: genomic clustering of SARS-CoV-2 sequences.
BMC Genomics
; 23(1): 710, 2022 Oct 19.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36258173
12.
Phylogeography and transmission of M. tuberculosis in Moldova: A prospective genomic analysis.
PLoS Med
; 19(2): e1003933, 2022 02.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35192619
13.
COVID-19 in schools: Mitigating classroom clusters in the context of variable transmission.
PLoS Comput Biol
; 17(7): e1009120, 2021 07.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34237051
14.
Estimation of SARS-CoV-2 antibody prevalence through serological uncertainty and daily incidence.
Can J Stat
; 50(3): 734-750, 2022 Sep.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36248322
15.
Quantifying the impact of COVID-19 control measures using a Bayesian model of physical distancing.
PLoS Comput Biol
; 16(12): e1008274, 2020 12.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33270633
16.
Long time frames to detect the impact of changing COVID-19 measures, Canada, March to July 2020.
Euro Surveill
; 26(40)2021 10.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34622758
17.
Transmission Trees on a Known Pathogen Phylogeny: Enumeration and Sampling.
Mol Biol Evol
; 36(6): 1333-1343, 2019 06 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30873529
18.
Beyond the SNP Threshold: Identifying Outbreak Clusters Using Inferred Transmissions.
Mol Biol Evol
; 36(3): 587-603, 2019 03 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30690464
19.
Predicting the short-term success of human influenza virus variants with machine learning.
Proc Biol Sci
; 287(1924): 20200319, 2020 04 08.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32259469
20.
Systematic comparison of coexistence in models of drug-sensitive and drug-resistant pathogen strains.
Theor Popul Biol
; 133: 150-158, 2020 06.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-31887315