Detalles de la búsqueda
1.
IntroVerse: a comprehensive database of introns across human tissues.
Nucleic Acids Res
; 51(D1): D167-D178, 2023 01 06.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36399497
2.
BiocMAP: a Bioconductor-friendly, GPU-accelerated pipeline for bisulfite-sequencing data.
BMC Bioinformatics
; 24(1): 340, 2023 Sep 13.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37704947
3.
Activity-regulated gene expression across cell types of the mouse hippocampus.
Hippocampus
; 33(9): 1009-1027, 2023 09.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37226416
4.
Recounting the FANTOM CAGE-Associated Transcriptome.
Genome Res
; 30(7): 1073-1081, 2020 07.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32079618
5.
SpatialExperiment: infrastructure for spatially-resolved transcriptomics data in R using Bioconductor.
Bioinformatics
; 38(11): 3128-3131, 2022 05 26.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35482478
6.
spatialLIBD: an R/Bioconductor package to visualize spatially-resolved transcriptomics data.
BMC Genomics
; 23(1): 434, 2022 Jun 10.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35689177
7.
Megadepth: efficient coverage quantification for BigWigs and BAMs.
Bioinformatics
; 37(18): 3014-3016, 2021 09 29.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33693500
8.
SPEAQeasy: a scalable pipeline for expression analysis and quantification for R/bioconductor-powered RNA-seq analyses.
BMC Bioinformatics
; 22(1): 224, 2021 May 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33932985
9.
Programmatic access to bacterial regulatory networks with regutools.
Bioinformatics
; 36(16): 4532-4534, 2020 08 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32573705
10.
Developmental effects of maternal smoking during pregnancy on the human frontal cortex transcriptome.
Mol Psychiatry
; 25(12): 3267-3277, 2020 12.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30131587
11.
Improving the value of public RNA-seq expression data by phenotype prediction.
Nucleic Acids Res
; 46(9): e54, 2018 05 18.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29514223
12.
Integrated Transcriptomic and Proteomic Analysis of Primary Human Umbilical Vein Endothelial Cells.
Proteomics
; 19(15): e1800315, 2019 08.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30983154
13.
Comprehensive assessment of multiple biases in small RNA sequencing reveals significant differences in the performance of widely used methods.
BMC Genomics
; 20(1): 513, 2019 Jun 21.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31226924
14.
Integrated DNA methylation and gene expression profiling across multiple brain regions implicate novel genes in Alzheimer's disease.
Acta Neuropathol
; 137(4): 557-569, 2019 04.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30712078
15.
Comment on: What genes are differentially expressed in individuals with schizophrenia? A systematic review.
Mol Psychiatry
; 28(2): 523-525, 2023 02.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36123423
16.
Flexible expressed region analysis for RNA-seq with derfinder.
Nucleic Acids Res
; 45(2): e9, 2017 01 25.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-27694310
17.
Rail-RNA: scalable analysis of RNA-seq splicing and coverage.
Bioinformatics
; 33(24): 4033-4040, 2017 Dec 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-27592709
18.
Correction to: SPEAQeasy: a scalable pipeline for expression analysis and quantification for R/bioconductorpowered RNAseq analyses.
BMC Bioinformatics
; 22(1): 381, 2021 Jul 22.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34294043
19.
Interspecies interactions that result in Bacillus subtilis forming biofilms are mediated mainly by members of its own genus.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 108(48): E1236-43, 2011 Nov 29.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-22074846
20.
lute: estimating the cell composition of heterogeneous tissue with varying cell sizes using gene expression.
bioRxiv
; 2024 Apr 06.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-38617294