Detalles de la búsqueda
1.
Modular assembly of dynamic models in systems biology.
PLoS Comput Biol
; 17(10): e1009513, 2021 10.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34644304
2.
Hierarchical semantic composition of biosimulation models using bond graphs.
PLoS Comput Biol
; 17(5): e1008859, 2021 05.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33983945
3.
Analysing and simulating energy-based models in biology using BondGraphTools.
Eur Phys J E Soft Matter
; 44(12): 148, 2021 Dec 13.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-34904197
4.
Ca2+ Release via IP3 Receptors Shapes the Cardiac Ca2+ Transient for Hypertrophic Signaling.
Biophys J
; 119(6): 1178-1192, 2020 09 15.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-32871099
5.
Physically-plausible modelling of biomolecular systems: A simplified, energy-based model of the mitochondrial electron transport chain.
J Theor Biol
; 493: 110223, 2020 05 21.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32119969
6.
A thermodynamic framework for modelling membrane transporters.
J Theor Biol
; 481: 10-23, 2019 11 21.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-30273576
7.
Insights on the impact of mitochondrial organisation on bioenergetics in high-resolution computational models of cardiac cell architecture.
PLoS Comput Biol
; 14(12): e1006640, 2018 12.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30517098
8.
Changes in mitochondrial morphology and organization can enhance energy supply from mitochondrial oxidative phosphorylation in diabetic cardiomyopathy.
Am J Physiol Cell Physiol
; 312(2): C190-C197, 2017 Feb 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-27903587
9.
Predictive modelling of gene expression from transcriptional regulatory elements.
Brief Bioinform
; 16(4): 616-28, 2015 Jul.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-25231769
10.
Virtual Reference Environments: a simple way to make research reproducible.
Brief Bioinform
; 16(5): 901-3, 2015 Sep.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-25433467
11.
Distributed gene expression modelling for exploring variability in epigenetic function.
BMC Bioinformatics
; 17(1): 446, 2016 Nov 05.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-27816056
12.
Systems analysis identifies miR-29b regulation of invasiveness in melanoma.
Mol Cancer
; 15(1): 72, 2016 11 16.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-27852308
13.
Myocardial energetics is not compromised during compensated hypertrophy in the Dahl salt-sensitive rat model of hypertension.
Am J Physiol Heart Circ Physiol
; 311(3): H563-71, 2016 09 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-27402668
14.
NAIL, a software toolset for inferring, analyzing and visualizing regulatory networks.
Bioinformatics
; 31(2): 277-8, 2015 Jan 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-25246431
15.
A Framework to Account for Sedimentation and Diffusion in Particle-Cell Interactions.
Langmuir
; 32(47): 12394-12402, 2016 11 29.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-27384770
16.
Examination of the Effects of Heterogeneous Organization of RyR Clusters, Myofibrils and Mitochondria on Ca2+ Release Patterns in Cardiomyocytes.
PLoS Comput Biol
; 11(9): e1004417, 2015 Sep.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-26335304
17.
Network analysis of an in vitro model of androgen-resistance in prostate cancer.
BMC Cancer
; 15: 883, 2015 Nov 10.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-26553226
18.
Stimulus-dependent differences in signalling regulate epithelial-mesenchymal plasticity and change the effects of drugs in breast cancer cell lines.
Cell Commun Signal
; 13: 26, 2015 May 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-25975820
19.
Gene network inference and visualization tools for biologists: application to new human transcriptome datasets.
Nucleic Acids Res
; 40(6): 2377-98, 2012 Mar.
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| MEDLINE | ID: mdl-22121215
20.
TRPV4 is expressed by enteric glia and muscularis macrophages of the colon but does not play a prominent role in colonic motility.
bioRxiv
; 2024 Jan 11.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-38260314