Detalles de la búsqueda
1.
PyPCN: protein contact networks in PyMOL.
Bioinformatics
; 39(11)2023 11 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37941462
2.
PCN-Miner: an open-source extensible tool for the analysis of Protein Contact Networks.
Bioinformatics
; 38(17): 4235-4237, 2022 09 02.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35799364
3.
A Statistical Journey through the Topological Determinants of the ß2 Adrenergic Receptor Dynamics.
Entropy (Basel)
; 24(7)2022 Jul 19.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35885221
4.
The Odd Faces of Oligomers: The Case of TRAF2-C, A Trimeric C-Terminal Domain of TNF Receptor-Associated Factor.
Int J Mol Sci
; 22(11)2021 May 30.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34070875
5.
The Discovery of a Putative Allosteric Site in the SARS-CoV-2 Spike Protein Using an Integrated Structural/Dynamic Approach.
J Proteome Res
; 19(11): 4576-4586, 2020 11 06.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32551648
6.
Fishery Wastes as a Yet Undiscovered Treasure from the Sea: Biomolecules Sources, Extraction Methods and Valorization.
Mar Drugs
; 18(12)2020 Dec 07.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33297310
7.
Auxin minimum triggers the developmental switch from cell division to cell differentiation in the Arabidopsis root.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 114(36): E7641-E7649, 2017 09 05.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28831001
8.
Cardiovascular Active Peptides of Marine Origin with ACE Inhibitory Activities: Potential Role as Anti-Hypertensive Drugs and in Prevention of SARS-CoV-2 Infection.
Int J Mol Sci
; 21(21)2020 Nov 07.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33171852
9.
GH32 family activity: a topological approach through protein contact networks.
Plant Mol Biol
; 92(4-5): 401-410, 2016 Nov.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-27503472
10.
Modules identification in protein structures: the topological and geometrical solutions.
J Chem Inf Model
; 54(1): 159-68, 2014 Jan 27.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-24289204
11.
Computational analysis of the sequence-structure relation in SARS-CoV-2 spike protein using protein contact networks.
Sci Rep
; 13(1): 2837, 2023 02 17.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36808182
12.
Head or tail? A molecular dynamics approach to the complex structure of TNF-associated factor TRAF2.
Biomol Concepts
; 14(1)2023 Jan 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37377424
13.
Biophysical Insight into the SARS-CoV2 Spike-ACE2 Interaction and Its Modulation by Hepcidin through a Multifaceted Computational Approach.
ACS Omega
; 7(20): 17024-17042, 2022 May 24.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35600142
14.
Dynamic Network Modeling of Allosteric Interactions and Communication Pathways in the SARS-CoV-2 Spike Trimer Mutants: Differential Modulation of Conformational Landscapes and Signal Transmission via Cascades of Regulatory Switches.
J Phys Chem B
; 125(3): 850-873, 2021 01 28.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33448856
15.
Integrated Biophysical Modeling of the SARS-CoV-2 Spike Protein Binding and Allosteric Interactions with Antibodies.
J Phys Chem B
; 125(18): 4596-4619, 2021 05 13.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33929853
16.
Disclosing Allostery Through Protein Contact Networks.
Methods Mol Biol
; 2253: 7-20, 2021.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33315215
17.
Protein Assembly: Defining the Strength of Protein-Protein Interactions Coupling the Theory with Experiments.
Methods Mol Biol
; 2253: 77-88, 2021.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33315219
18.
Non-symmetrical structural behavior of a symmetric protein: the case of homo-trimeric TRAF2 (tumor necrosis factor-receptor associated factor 2).
J Biomol Struct Dyn
; 39(1): 319-329, 2021 Jan.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31980009
19.
Polymorphism on human aromatase affects protein dynamics and substrate binding: spectroscopic evidence.
Biol Direct
; 16(1): 8, 2021 04 26.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33902660
20.
Novel indole derivatives targeting HuR-mRNA complex to counteract high glucose damage in retinal endothelial cells.
Biochem Pharmacol
; 175: 113908, 2020 05.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32171729