Detalles de la búsqueda
1.
Chiral evasion and stereospecific antifolate resistance in Staphylococcus aureus.
PLoS Comput Biol
; 18(2): e1009855, 2022 02.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35143481
2.
Novel, provable algorithms for efficient ensemble-based computational protein design and their application to the redesign of the c-Raf-RBD:KRas protein-protein interface.
PLoS Comput Biol
; 16(6): e1007447, 2020 06.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32511232
3.
OSPREY 3.0: Open-source protein redesign for you, with powerful new features.
J Comput Chem
; 39(30): 2494-2507, 2018 11 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30368845
4.
CATS (Coordinates of Atoms by Taylor Series): protein design with backbone flexibility in all locally feasible directions.
Bioinformatics
; 33(14): i5-i12, 2017 Jul 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28882005
5.
A critical analysis of computational protein design with sparse residue interaction graphs.
PLoS Comput Biol
; 13(3): e1005346, 2017 03.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28358804
6.
Protein design algorithms predict viable resistance to an experimental antifolate.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 112(3): 749-54, 2015 Jan 20.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-25552560
7.
Structure of an HIV-1-neutralizing antibody target, the lipid-bound gp41 envelope membrane proximal region trimer.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 111(4): 1391-6, 2014 Jan 28.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-24474763
8.
Fast search algorithms for computational protein design.
J Comput Chem
; 37(12): 1048-58, 2016 May 05.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-26833706
9.
Improved energy bound accuracy enhances the efficiency of continuous protein design.
Proteins
; 83(6): 1151-64, 2015 Jun.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-25846627
10.
Systematic solution to homo-oligomeric structures determined by NMR.
Proteins
; 83(4): 651-61, 2015 Apr.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-25620116
11.
Fast gap-free enumeration of conformations and sequences for protein design.
Proteins
; 83(10): 1859-1877, 2015 Oct.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-26235965
12.
Enhanced potency of a broadly neutralizing HIV-1 antibody in vitro improves protection against lentiviral infection in vivo.
J Virol
; 88(21): 12669-82, 2014 Nov.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-25142607
13.
An efficient parallel algorithm for accelerating computational protein design.
Bioinformatics
; 30(12): i255-i263, 2014 Jun 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-24931991
14.
Protein Design by Provable Algorithms.
Commun ACM
; 62(10): 76-84, 2019 Oct.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31607753
15.
DexDesign: A new OSPREY-based algorithm for designing de novo D-peptide inhibitors.
bioRxiv
; 2024 Feb 14.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38405797
16.
DexDesign: an OSPREY-based algorithm for designing de novo D-peptide inhibitors.
Protein Eng Des Sel
; 372024 Jan 29.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38757573
17.
Dead-end elimination with perturbations (DEEPer): a provable protein design algorithm with continuous sidechain and backbone flexibility.
Proteins
; 81(1): 18-39, 2013 Jan.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-22821798
18.
Protein design using continuous rotamers.
PLoS Comput Biol
; 8(1): e1002335, 2012 Jan.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-22279426
19.
Computational design of a PDZ domain peptide inhibitor that rescues CFTR activity.
PLoS Comput Biol
; 8(4): e1002477, 2012.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-22532795
20.
The role of local backrub motions in evolved and designed mutations.
PLoS Comput Biol
; 8(8): e1002629, 2012.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-22876172