Detalles de la búsqueda
1.
Chromosome-level organization of the regulatory genome in the Drosophila nervous system.
Cell
; 186(18): 3826-3844.e26, 2023 08 31.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37536338
2.
Are TADs supercoiled?
Nucleic Acids Res
; 47(2): 521-532, 2019 01 25.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30395328
3.
Closing the DNA replication cycle: from simple circular molecules to supercoiled and knotted DNA catenanes.
Nucleic Acids Res
; 47(14): 7182-7198, 2019 08 22.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31276584
4.
KnotProt 2.0: a database of proteins with knots and other entangled structures.
Nucleic Acids Res
; 47(D1): D367-D375, 2019 01 08.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30508159
5.
Transcription-induced supercoiling as the driving force of chromatin loop extrusion during formation of TADs in interphase chromosomes.
Nucleic Acids Res
; 46(4): 1648-1660, 2018 02 28.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29140466
6.
Knoto-ID: a tool to study the entanglement of open protein chains using the concept of knotoids.
Bioinformatics
; 34(19): 3402-3404, 2018 10 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29722808
7.
Transcription-induced supercoiling explains formation of self-interacting chromatin domains in S. pombe.
Nucleic Acids Res
; 45(17): 9850-9859, 2017 Sep 29.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28973473
8.
How topoisomerase IV can efficiently unknot and decatenate negatively supercoiled DNA molecules without causing their torsional relaxation.
Nucleic Acids Res
; 44(10): 4528-38, 2016 06 02.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-27106058
9.
Generation of supercoils in nicked and gapped DNA drives DNA unknotting and postreplicative decatenation.
Nucleic Acids Res
; 43(15): 7229-36, 2015 Sep 03.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-26150424
10.
Effects of physiological self-crowding of DNA on shape and biological properties of DNA molecules with various levels of supercoiling.
Nucleic Acids Res
; 43(4): 2390-9, 2015 Feb 27.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-25653164
11.
Boolean regulatory network reconstruction using literature based knowledge with a genetic algorithm optimization method.
BMC Bioinformatics
; 17(1): 410, 2016 Oct 06.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-27716031
12.
Effects of supercoiling on enhancer-promoter contacts.
Nucleic Acids Res
; 42(16): 10425-32, 2014.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-25123662
13.
Models that include supercoiling of topological domains reproduce several known features of interphase chromosomes.
Nucleic Acids Res
; 42(5): 2848-55, 2014 Mar.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-24366878
14.
Modelling of crowded polymers elucidate effects of double-strand breaks in topological domains of bacterial chromosomes.
Nucleic Acids Res
; 41(14): 6808-15, 2013 Aug.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-23742906
15.
Comparative assessment of cytometry by time-of-flight and full spectral flow cytometry based on a 33-color antibody panel.
J Immunol Methods
; 527: 113641, 2024 04.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38365120
16.
Cooperative kinking at distant sites in mechanically stressed DNA.
Nucleic Acids Res
; 39(22): 9820-32, 2011 Dec.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-21917856
17.
The role of transcription factories-mediated interchromosomal contacts in the organization of nuclear architecture.
Nucleic Acids Res
; 38(21): 7410-21, 2010 Nov.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-20675721
18.
Essential role of Cp190 in physical and regulatory boundary formation.
Sci Adv
; 8(19): eabl8834, 2022 May 13.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35559678
19.
Topological origins of chromosomal territories.
Nucleic Acids Res
; 37(19): 6316-22, 2009 Oct.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-19726582
20.
A single-cell morpho-transcriptomic map of brassinosteroid action in the Arabidopsis root.
Mol Plant
; 14(12): 1985-1999, 2021 12 06.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34358681