Detalles de la búsqueda
1.
Efficient computation of contributional diversity metrics from microbiome data with FuncDiv.
Bioinformatics
; 39(1)2023 01 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36519836
2.
Integrating phylogenetic and functional data in microbiome studies.
Bioinformatics
; 38(22): 5055-5063, 2022 11 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36179077
3.
Hybrid origins and the earliest stages of diploidization in the highly successful recent polyploid Capsella bursa-pastoris.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 112(9): 2806-11, 2015 Mar 03.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-25691747
4.
Decreased Transcription Factor Binding Levels Nearby Primate Pseudogenes Suggest Regulatory Degeneration.
Mol Biol Evol
; 33(6): 1478-85, 2016 06.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-26882985
5.
Pseudogenes act as a neutral reference for detecting selection in prokaryotic pangenomes.
Nat Ecol Evol
; 8(2): 304-314, 2024 Feb.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38177690
6.
Longitudinal genomic surveillance of multidrug-resistant Escherichia coli carriage in critical care patients.
Microbiol Spectr
; 12(2): e0312823, 2024 Feb 06.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38171007
7.
Microbiome differential abundance methods produce different results across 38 datasets.
Nat Commun
; 13(1): 342, 2022 01 17.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35039521
8.
Genic Selection Within Prokaryotic Pangenomes.
Genome Biol Evol
; 13(11)2021 11 05.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34665261
9.
Transcriptomic profiling of Brassica napus responses to Pseudomonas aeruginosa.
Innate Immun
; 27(2): 143-157, 2021 02.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33353474
10.
Re-evaluating the relationship between missing heritability and the microbiome.
Microbiome
; 8(1): 87, 2020 06 08.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32513310
11.
Detection of Helicobacter pylori Microevolution and Multiple Infection from Gastric Biopsies by Housekeeping Gene Amplicon Sequencing.
Pathogens
; 9(2)2020 Feb 05.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32033301
12.
The human tumor microbiome is composed of tumor type-specific intracellular bacteria.
Science
; 368(6494): 973-980, 2020 05 29.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32467386
13.
Current and Promising Approaches to Identify Horizontal Gene Transfer Events in Metagenomes.
Genome Biol Evol
; 11(10): 2750-2766, 2019 10 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31504488
14.
Metagenomic Functional Shifts to Plant Induced Environmental Changes.
Front Microbiol
; 10: 1682, 2019.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31404278
15.
Enhancement of the gut barrier integrity by a microbial metabolite through the Nrf2 pathway.
Nat Commun
; 10(1): 89, 2019 01 09.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30626868
16.
Author Correction: Reproducible, interactive, scalable and extensible microbiome data science using QIIME 2.
Nat Biotechnol
; 37(9): 1091, 2019 Sep.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31399723
17.
Processing a 16S rRNA Sequencing Dataset with the Microbiome Helper Workflow.
Methods Mol Biol
; 1849: 131-141, 2018.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30298252
18.
Predicting the Functional Potential of the Microbiome from Marker Genes Using PICRUSt.
Methods Mol Biol
; 1849: 169-177, 2018.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30298254
19.
Denoising the Denoisers: an independent evaluation of microbiome sequence error-correction approaches.
PeerJ
; 6: e5364, 2018.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30123705
20.
Dissecting Community Structure in Wild Blueberry Root and Soil Microbiome.
Front Microbiol
; 9: 1187, 2018.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29922264