Detalles de la búsqueda
1.
Dynamic gene expression and growth underlie cell-to-cell heterogeneity in Escherichia coli stress response.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 119(14): e2115032119, 2022 04 05.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35344432
2.
DeLTA 2.0: A deep learning pipeline for quantifying single-cell spatial and temporal dynamics.
PLoS Comput Biol
; 18(1): e1009797, 2022 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35041653
3.
Programmable gene regulation for metabolic engineering using decoy transcription factor binding sites.
Nucleic Acids Res
; 49(2): 1163-1172, 2021 01 25.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33367820
4.
DeLTA: Automated cell segmentation, tracking, and lineage reconstruction using deep learning.
PLoS Comput Biol
; 16(4): e1007673, 2020 04.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32282792
5.
Salicylate Increases Fitness Cost Associated with MarA-Mediated Antibiotic Resistance.
Biophys J
; 117(3): 563-571, 2019 08 06.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31349991
6.
Distinct timescales of RNA regulators enable the construction of a genetic pulse generator.
Biotechnol Bioeng
; 116(5): 1139-1151, 2019 05.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30636320
7.
Active degradation of MarA controls coordination of its downstream targets.
PLoS Comput Biol
; 14(12): e1006634, 2018 12.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30589845
8.
Stress Introduction Rate Alters the Benefit of AcrAB-TolC Efflux Pumps.
J Bacteriol
; 200(1)2018 01 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29038251
9.
Customized Regulation of Diverse Stress Response Genes by the Multiple Antibiotic Resistance Activator MarA.
PLoS Comput Biol
; 13(1): e1005310, 2017 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28060821
10.
Phenotypic Diversity Using Bimodal and Unimodal Expression of Stress Response Proteins.
Biophys J
; 110(10): 2278-87, 2016 05 24.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-27224492
11.
Noise and low-level dynamics can coordinate multicomponent bet hedging mechanisms.
Biophys J
; 108(1): 184-93, 2015 Jan 06.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-25564865
12.
Tunable stochastic pulsing in the Escherichia coli multiple antibiotic resistance network from interlinked positive and negative feedback loops.
PLoS Comput Biol
; 9(9): e1003229, 2013.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-24086119
13.
Generating information-dense promoter sequences with optimal string packing.
bioRxiv
; 2024 Feb 02.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37961203
14.
Deep model predictive control of gene expression in thousands of single cells.
Nat Commun
; 15(1): 2148, 2024 Mar 08.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38459057
15.
Light-inducible protein degradation in E. coli with the LOVdeg tag.
Elife
; 122024 Jan 25.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38270583
16.
Advances in linking single-cell bacterial stress response to population-level survival.
Curr Opin Biotechnol
; 79: 102885, 2023 02.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36641904
17.
An optogenetic toolkit for light-inducible antibiotic resistance.
Nat Commun
; 14(1): 1034, 2023 02 23.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36823420
18.
Light inducible protein degradation in E. coli with the LOVdeg tag.
bioRxiv
; 2023 Oct 26.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36865169
19.
Deep Neural Networks for Predicting Single-Cell Responses and Probability Landscapes.
ACS Synth Biol
; 12(8): 2367-2381, 2023 08 18.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37467372
20.
Comprehensive Screening of a Light-Inducible Split Cre Recombinase with Domain Insertion Profiling.
ACS Synth Biol
; 12(10): 2834-2842, 2023 10 20.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37788288