Detalles de la búsqueda
1.
Hydroxylation Regiochemistry Is Robust to Active Site Mutations in Cytochrome P450cam (CYP101A1).
Biochemistry
; 61(17): 1790-1800, 2022 09 06.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35960510
2.
Causes of evolutionary rate variation among protein sites.
Nat Rev Genet
; 17(2): 109-21, 2016 Feb.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-26781812
3.
Evolutionary coupling range varies widely among enzymes depending on selection pressure.
Biophys J
; 120(20): 4320-4324, 2021 10 19.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34480927
4.
Beyond Stability Constraints: A Biophysical Model of Enzyme Evolution with Selection on Stability and Activity.
Mol Biol Evol
; 36(3): 613-620, 2019 03 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30590616
5.
Functional Sites Induce Long-Range Evolutionary Constraints in Enzymes.
PLoS Biol
; 14(5): e1002452, 2016 05.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-27138088
6.
Site-specific structural constraints on protein sequence evolutionary divergence: local packing density versus solvent exposure.
Mol Biol Evol
; 31(1): 135-9, 2014 Jan.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-24109601
7.
Relationship between protein thermodynamic constraints and variation of evolutionary rates among sites.
Phys Biol
; 12(2): 025002, 2015 Mar 19.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-25787027
8.
A mechanistic stress model of protein evolution accounts for site-specific evolutionary rates and their relationship with packing density and flexibility.
BMC Evol Biol
; 14: 78, 2014 Apr 09.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-24716445
9.
Measuring and comparing structural fluctuation patterns in large protein datasets.
Bioinformatics
; 28(19): 2431-40, 2012 Oct 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-22796957
10.
Fast computational mutation-response scanning of proteins.
PeerJ
; 9: e11330, 2021.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33976988
11.
A perturbative view of protein structural variation.
Proteins
; 78(1): 173-80, 2010 Jan.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-19731380
12.
The variation among sites of protein structure divergence is shaped by mutation and scaled by selection.
Curr Res Struct Biol
; 2: 156-163, 2020.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34235475
13.
Evolutionary conservation of protein vibrational dynamics.
Gene
; 422(1-2): 7-13, 2008 Oct 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-18577430
14.
Teaching noncovalent interactions using protein molecular evolution.
Biochem Mol Biol Educ
; 36(4): 284-6, 2008 Jul.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-21591205
15.
What evolution tells us about protein physics, and protein physics tells us about evolution.
Curr Opin Struct Biol
; 42: 59-66, 2017 02.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-27865208
16.
Biophysical Models of Protein Evolution: Understanding the Patterns of Evolutionary Sequence Divergence.
Annu Rev Biophys
; 46: 85-103, 2017 05 22.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28301766
17.
Molecular dynamics study of the active site of methylamine dehydrogenase.
J Phys Chem B
; 110(23): 11592-9, 2006 Jun 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-16771436
18.
Assessing local structural perturbations in proteins.
BMC Bioinformatics
; 6: 226, 2005 Sep 13.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-16159393
19.
Generality of the structurally constrained protein evolution model: assessment on representatives of the four main fold classes.
Gene
; 345(1): 45-53, 2005 Jan 17.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-15716088
20.
Too packed to change: side-chain packing and site-specific substitution rates in protein evolution.
PeerJ
; 3: e911, 2015.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-25922797