Detalles de la búsqueda
1.
Matrix factorization and transfer learning uncover regulatory biology across multiple single-cell ATAC-seq data sets.
Nucleic Acids Res
; 48(12): e68, 2020 07 09.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32392348
2.
Allele-specific nonstationarity in evolution of influenza A virus surface proteins.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 116(42): 21104-21112, 2019 10 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31578251
3.
Enter the Matrix: Factorization Uncovers Knowledge from Omics.
Trends Genet
; 34(10): 790-805, 2018 10.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-30143323
4.
Inferring causal molecular networks: empirical assessment through a community-based effort.
Nat Methods
; 13(4): 310-8, 2016 Apr.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-26901648
5.
Splice Expression Variation Analysis (SEVA) for inter-tumor heterogeneity of gene isoform usage in cancer.
Bioinformatics
; 34(11): 1859-1867, 2018 06 01.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-29342249
6.
StereoGene: rapid estimation of genome-wide correlation of continuous or interval feature data.
Bioinformatics
; 33(20): 3158-3165, 2017 Oct 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29028265
7.
PatternMarkers & GWCoGAPS for novel data-driven biomarkers via whole transcriptome NMF.
Bioinformatics
; 33(12): 1892-1894, 2017 Jun 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28174896
8.
Genetic risk factors for myocardial infarction more clearly manifest for early age of first onset.
Mol Biol Rep
; 44(4): 315-321, 2017 Aug.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-28685248
9.
Natural variation of gene models in Drosophila melanogaster.
BMC Genomics
; 16: 198, 2015 Mar 17.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-25888292
10.
Preserving biological heterogeneity with a permuted surrogate variable analysis for genomics batch correction.
Bioinformatics
; 30(19): 2757-63, 2014 Oct.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-24907368
11.
CORECLUST: identification of the conserved CRM grammar together with prediction of gene regulation.
Nucleic Acids Res
; 40(12): e93, 2012 Jul.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-22422836
12.
Uncovering the spatial landscape of molecular interactions within the tumor microenvironment through latent spaces.
Cell Syst
; 14(4): 285-301.e4, 2023 04 19.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-37080163
13.
Investigation of the Role of PUFA Metabolism in Breast Cancer Using a Rank-Based Random Forest Algorithm.
Cancers (Basel)
; 14(19)2022 Sep 25.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36230586
14.
Deconvolution of B cell receptor repertoire in multiple sclerosis patients revealed a delay in tBreg maturation.
Front Immunol
; 13: 803229, 2022.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36052064
15.
CoGAPS: an R/C++ package to identify patterns and biological process activity in transcriptomic data.
Bioinformatics
; 26(21): 2792-3, 2010 Nov 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-20810601
16.
Spatial correlation statistics enable transcriptome-wide characterization of RNA structure binding.
Cell Rep Methods
; 1(6): 100088, 2021 10 25.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35474897
17.
Landscape of allele-specific transcription factor binding in the human genome.
Nat Commun
; 12(1): 2751, 2021 05 12.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-33980847
18.
Newly Identified Members of FGFR1 Splice Variants Engage in Cross-talk with AXL/AKT Axis in Salivary Adenoid Cystic Carcinoma.
Cancer Res
; 81(4): 1001-1013, 2021 02 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33408119
19.
Motif discovery and motif finding from genome-mapped DNase footprint data.
Bioinformatics
; 25(18): 2318-25, 2009 Sep 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-19605419
20.
Extracellular Vesicles Released by Tumor Endothelial Cells Spread Immunosuppressive and Transforming Signals Through Various Recipient Cells.
Front Cell Dev Biol
; 8: 698, 2020.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-33015029