Detalles de la búsqueda
1.
Synthetic riboswitches for the analysis of tRNA processing by eukaryotic RNase P enzymes.
RNA
; 28(4): 551-567, 2022 04.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35022261
2.
Ligand-dependent tRNA processing by a rationally designed RNase P riboswitch.
Nucleic Acids Res
; 49(3): 1784-1800, 2021 02 22.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33469651
3.
Beyond Plug and Pray: Context Sensitivity and in silico Design of Artificial Neomycin Riboswitches.
RNA Biol
; 18(4): 457-467, 2021 04.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32882151
4.
Evolving methods for rational de novo design of functional RNA molecules.
Methods
; 161: 54-63, 2019 05 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31059832
5.
In silico design of ligand triggered RNA switches.
Methods
; 143: 90-101, 2018 07 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29660485
6.
Applicability of a computational design approach for synthetic riboswitches.
Nucleic Acids Res
; 45(7): 4108-4119, 2017 04 20.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-27994029
7.
RNAblueprint: flexible multiple target nucleic acid sequence design.
Bioinformatics
; 33(18): 2850-2858, 2017 Sep 15.
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en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28449031
8.
Design of Artificial Riboswitches as Biosensors.
Sensors (Basel)
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Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28867802
9.
The primary transcriptome of the major human pathogen Helicobacter pylori.
Nature
; 464(7286): 250-5, 2010 Mar 11.
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en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-20164839
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Design criteria for synthetic riboswitches acting on transcription.
RNA Biol
; 12(2): 221-31, 2015.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-25826571
11.
De novo design of a synthetic riboswitch that regulates transcription termination.
Nucleic Acids Res
; 41(4): 2541-51, 2013 Feb 01.
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en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-23275562
12.
TSSAR: TSS annotation regime for dRNA-seq data.
BMC Bioinformatics
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Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-24674136
13.
Bioinformatics of prokaryotic RNAs.
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en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-24755880
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Genome-wide transcriptome analysis of the plant pathogen Xanthomonas identifies sRNAs with putative virulence functions.
Nucleic Acids Res
; 40(5): 2020-31, 2012 Mar.
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en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-22080557
15.
Assessing the Quality of Cotranscriptional Folding Simulations.
Methods Mol Biol
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en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38780738
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RNAcode: robust discrimination of coding and noncoding regions in comparative sequence data.
RNA
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| MEDLINE | ID: mdl-21357752
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Mapping the RNA-Seq trash bin: unusual transcripts in prokaryotic transcriptome sequencing data.
RNA Biol
; 10(7): 1204-10, 2013 Jul.
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en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-23702463
18.
Tailored machine learning models for functional RNA detection in genome-wide screens.
NAR Genom Bioinform
; 5(3): lqad072, 2023 Sep.
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| MEDLINE | ID: mdl-37608800
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RNA Design Principles for Riboswitches that Regulate RNase P-Mediated tRNA Processing.
Methods Mol Biol
; 2518: 179-202, 2022.
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en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35666446
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Proteinortho: detection of (co-)orthologs in large-scale analysis.
BMC Bioinformatics
; 12: 124, 2011 Apr 28.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-21526987