Detalles de la búsqueda
1.
Positive supercoiling favors transcription elongation through lac repressor-mediated DNA loops.
Nucleic Acids Res
; 50(5): 2826-2835, 2022 03 21.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35188572
2.
Basic mechanisms and kinetics of pause-interspersed transcript elongation.
Nucleic Acids Res
; 49(1): 15-24, 2021 01 11.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33330935
3.
Nanomechanics of negatively supercoiled diaminopurine-substituted DNA.
Nucleic Acids Res
; 49(20): 11778-11786, 2021 11 18.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34718727
4.
Negative DNA supercoiling makes protein-mediated looping deterministic and ergodic within the bacterial doubling time.
Nucleic Acids Res
; 49(20): 11550-11559, 2021 11 18.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34723343
5.
Macromolecular Crowding and DNA: Bridging the Gap between In Vitro and In Vivo.
Int J Mol Sci
; 24(24)2023 Dec 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38139331
6.
Energetics of twisted DNA topologies.
Biophys J
; 120(16): 3242-3252, 2021 08 17.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33974883
7.
Protein-mediated loops in supercoiled DNA create large topological domains.
Nucleic Acids Res
; 46(9): 4417-4424, 2018 05 18.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29538766
8.
Protein-mediated looping of DNA under tension requires supercoiling.
Nucleic Acids Res
; 46(5): 2370-2379, 2018 03 16.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29365152
9.
Model-free 3D localization with precision estimates for brightfield-imaged particles.
Opt Express
; 27(21): 29875-29895, 2019 Oct 14.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31684243
10.
DNA supercoiling: a regulatory signal for the λ repressor.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 111(43): 15402-7, 2014 Oct 28.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-25319264
11.
MADS domain transcription factors mediate short-range DNA looping that is essential for target gene expression in Arabidopsis.
Plant Cell
; 25(7): 2560-72, 2013 Jul.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-23847151
12.
Single molecule analysis of DNA wrapping and looping by a circular 14mer wheel of the bacteriophage 186 CI repressor.
Nucleic Acids Res
; 41(11): 5746-56, 2013 Jun.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-23620280
13.
Enhanced tethered-particle motion analysis reveals viscous effects.
Biophys J
; 106(2): 399-409, 2014 Jan 21.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-24461015
14.
Multilevel autoregulation of λ repressor protein CI by DNA looping in vitro.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 108(36): 14807-12, 2011 Sep 06.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-21873207
15.
Detecting DNA Loops Using Tethered Particle Motion.
Methods Mol Biol
; 2694: 451-466, 2024.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37824017
16.
Reciprocating RNA Polymerase batters through roadblocks.
Nat Commun
; 15(1): 3193, 2024 Apr 12.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38609371
17.
Purification of bacteriophage lambda repressor.
Protein Expr Purif
; 91(1): 30-6, 2013 Sep.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-23831434
18.
Reciprocating RNA Polymerase batters through roadblocks.
bioRxiv
; 2023 Jun 26.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36711567
19.
The effect of nonspecific binding of lambda repressor on DNA looping dynamics.
Biophys J
; 103(8): 1753-61, 2012 Oct 17.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-23083719
20.
Thermodynamic model of bacterial transcription.
Phys Rev E
; 106(4-1): 044406, 2022 Oct.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36397483