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1.
Bringing discrete-time Langevin splitting methods into agreement with thermodynamics.
J Chem Phys
; 155(18): 184104, 2021 Nov 14.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34773954
2.
Coexistence of Lipid Phases Stabilizes Interstitial Water in the Outer Layer of Mammalian Skin.
Biophys J
; 118(7): 1588-1601, 2020 04 07.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32101711
3.
Direct Derivation of Free Energies of Membrane Deformation and Other Solvent Density Variations From Enhanced Sampling Molecular Dynamics.
J Comput Chem
; 41(5): 449-459, 2020 02 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31602694
4.
The challenge of stochastic Størmer-Verlet thermostats generating correct statistics.
J Chem Phys
; 153(13): 134101, 2020 Oct 07.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33032435
5.
Data-guided Multi-Map variables for ensemble refinement of molecular movies.
J Chem Phys
; 153(21): 214102, 2020 Dec 07.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33291927
6.
Scalable molecular dynamics on CPU and GPU architectures with NAMD.
J Chem Phys
; 153(4): 044130, 2020 Jul 28.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32752662
7.
High-resolution structures of the M2 channel from influenza A virus reveal dynamic pathways for proton stabilization and transduction.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 112(46): 14260-5, 2015 Nov 17.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-26578770
8.
Structural Refinement of Proteins by Restrained Molecular Dynamics Simulations with Non-interacting Molecular Fragments.
PLoS Comput Biol
; 11(10): e1004368, 2015 Oct.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-26505197
9.
Infrared and fluorescence assessment of the hydration status of the tryptophan gate in the influenza A M2 proton channel.
Phys Chem Chem Phys
; 18(41): 28939-28950, 2016 Oct 19.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-27725984
10.
Pore waters regulate ion permeation in a calcium release-activated calcium channel.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 110(43): 17332-7, 2013 Oct 22.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-24101457
11.
Structure and inhibition of the drug-resistant S31N mutant of the M2 ion channel of influenza A virus.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 110(4): 1315-20, 2013 Jan 22.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-23302696
12.
How Sensitive is the Amideâ I Vibration of the Polypeptide Backbone to Electric Fields?
Chemphyschem
; 16(17): 3595-8, 2015 Dec 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-26419214
13.
Molecular dynamics simulations of cholesterol-rich membranes using a coarse-grained force field for cyclic alkanes.
J Chem Phys
; 143(24): 243144, 2015 Dec 28.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-26723629
14.
Flipping in the pore: discovery of dual inhibitors that bind in different orientations to the wild-type versus the amantadine-resistant S31N mutant of the influenza A virus M2 proton channel.
J Am Chem Soc
; 136(52): 17987-95, 2014 Dec 31.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-25470189
15.
Structure of water at charged interfaces: a molecular dynamics study.
Langmuir
; 30(27): 8056-65, 2014 Jul 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-24979659
16.
Dehydration of multilamellar fatty acid membranes: towards a computational model of the stratum corneum.
J Chem Phys
; 141(22): 22D526, 2014 Dec 14.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-25494797
17.
Transmembrane orientation and possible role of the fusogenic peptide from parainfluenza virus 5 (PIV5) in promoting fusion.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 108(10): 3958-63, 2011 Mar 08.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-21321234
18.
Structure and mechanism of proton transport through the transmembrane tetrameric M2 protein bundle of the influenza A virus.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 107(34): 15075-80, 2010 Aug 24.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-20689043
19.
Membrane free-energy landscapes derived from atomistic dynamics explain nonuniversal cholesterol-induced stiffening.
bioRxiv
; 2023 Feb 17.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-36778237
20.
Membrane free-energy landscapes derived from atomistic dynamics explain nonuniversal cholesterol-induced stiffening.
PNAS Nexus
; 2(8): pgad269, 2023 Aug.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-37637198