Detalles de la búsqueda
1.
Modeling fragment counts improves single-cell ATAC-seq analysis.
Nat Methods
; 21(1): 28-31, 2024 Jan.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38049697
2.
Probing cell identity hierarchies by fate titration and collision during direct reprogramming.
Mol Syst Biol
; 18(9): e11129, 2022 09.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36106915
3.
Ultra-high sensitivity mass spectrometry quantifies single-cell proteome changes upon perturbation.
Mol Syst Biol
; 18(3): e10798, 2022 03.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35226415
4.
Concepts and limitations for learning developmental trajectories from single cell genomics.
Development
; 146(12)2019 06 27.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31249007
5.
Automatic identification of relevant genes from low-dimensional embeddings of single-cell RNA-seq data.
Bioinformatics
; 36(15): 4291-4295, 2020 08 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32207520
6.
Predicting antigen specificity of single T cells based on TCR CDR3 regions.
Mol Syst Biol
; 16(8): e9416, 2020 08.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32779888
7.
Impulse model-based differential expression analysis of time course sequencing data.
Nucleic Acids Res
; 46(20): e119, 2018 11 16.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30102402
8.
Modeling intercellular communication in tissues using spatial graphs of cells.
Nat Biotechnol
; 41(3): 332-336, 2023 03.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36302986
9.
Scaling cross-tissue single-cell annotation models.
bioRxiv
; 2023 Oct 10.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37873298
10.
Programs, Origins, and Niches of Immunomodulatory Myeloid Cells in Gliomas.
bioRxiv
; 2023 Oct 27.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37961527
11.
Toward modeling metabolic state from single-cell transcriptomics.
Mol Metab
; 57: 101396, 2022 03.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34785394
12.
Spatial components of molecular tissue biology.
Nat Biotechnol
; 40(3): 308-318, 2022 03.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35132261
13.
Cell-Type-Specific Impact of Glucocorticoid Receptor Activation on the Developing Brain: A Cerebral Organoid Study.
Am J Psychiatry
; 179(5): 375-387, 2022 05.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34698522
14.
Group Testing for SARS-CoV-2 Allows for Up to 10-Fold Efficiency Increase Across Realistic Scenarios and Testing Strategies.
Front Public Health
; 9: 583377, 2021.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34490172
15.
Sfaira accelerates data and model reuse in single cell genomics.
Genome Biol
; 22(1): 248, 2021 08 25.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34433466
16.
EpiScanpy: integrated single-cell epigenomic analysis.
Nat Commun
; 12(1): 5228, 2021 09 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34471111
17.
Single-cell RNA sequencing reveals ex vivo signatures of SARS-CoV-2-reactive T cells through 'reverse phenotyping'.
Nat Commun
; 12(1): 4515, 2021 07 26.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34312385
18.
Single-cell meta-analysis of SARS-CoV-2 entry genes across tissues and demographics.
Nat Med
; 27(3): 546-559, 2021 03.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33654293
19.
MPRAnalyze: statistical framework for massively parallel reporter assays.
Genome Biol
; 20(1): 183, 2019 09 02.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31477158
20.
Inferring population dynamics from single-cell RNA-sequencing time series data.
Nat Biotechnol
; 37(4): 461-468, 2019 04.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-30936567