Detalles de la búsqueda
1.
"Minimal metabolism": A key concept to investigate the origins and nature of biological systems.
Bioessays
; 43(10): e2100103, 2021 10.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34426986
2.
Graph transformation for enzymatic mechanisms.
Bioinformatics
; 37(Suppl_1): i392-i400, 2021 07 12.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34252947
3.
Representing Catalytic Mechanisms with Rule Composition.
J Chem Inf Model
; 62(22): 5513-5524, 2022 11 28.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36326605
4.
EHreact: Extended Hasse Diagrams for the Extraction and Scoring of Enzymatic Reaction Templates.
J Chem Inf Model
; 61(10): 4949-4961, 2021 10 25.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34587449
5.
Efficient computation of co-transcriptional RNA-ligand interaction dynamics.
Methods
; 143: 70-76, 2018 07 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29730250
6.
In silico design of ligand triggered RNA switches.
Methods
; 143: 90-101, 2018 07 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29660485
7.
RNAblueprint: flexible multiple target nucleic acid sequence design.
Bioinformatics
; 33(18): 2850-2858, 2017 Sep 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28449031
8.
Sequence-controlled RNA self-processing: computational design, biochemical analysis, and visualization by AFM.
RNA
; 21(7): 1249-60, 2015 Jul.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-25999318
9.
An intermediate level of abstraction for computational systems chemistry.
Philos Trans A Math Phys Eng Sci
; 375(2109)2017 Dec 28.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29133452
10.
Memory-efficient RNA energy landscape exploration.
Bioinformatics
; 30(18): 2584-91, 2014 Sep 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-24833804
11.
Computational design of RNAs with complex energy landscapes.
Biopolymers
; 99(12): 1124-36, 2013 Dec.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-23818234
12.
Statistical mechanics of biomolecular condensates via cavity methods.
iScience
; 26(4): 106300, 2023 Apr 21.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36994084
13.
BarMap: RNA folding on dynamic energy landscapes.
RNA
; 16(7): 1308-16, 2010 Jul.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-20504954
14.
Modelling translation initiation under the influence of sRNA.
Int J Mol Sci
; 13(12): 16223-40, 2012 Nov 30.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-23203192
15.
What makes a reaction network "chemical"?
J Cheminform
; 14(1): 63, 2022 Sep 19.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36123755
16.
Generic Context-Aware Group Contributions.
IEEE/ACM Trans Comput Biol Bioinform
; 19(1): 429-442, 2022.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32750852
17.
Caveats to Deep Learning Approaches to RNA Secondary Structure Prediction.
Front Bioinform
; 2: 835422, 2022.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36304289
18.
Chemical Transformation Motifs-Modelling Pathways as Integer Hyperflows.
IEEE/ACM Trans Comput Biol Bioinform
; 16(2): 510-523, 2019.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29990045
19.
Finding the K best synthesis plans.
J Cheminform
; 10(1): 19, 2018 Apr 05.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29623440
20.
RNA structure prediction: from 2D to 3D.
Emerg Top Life Sci
; 1(3): 275-285, 2017 Nov 14.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33525808