Detalles de la búsqueda
1.
Cardinality optimization in constraint-based modelling: application to human metabolism.
Bioinformatics
; 39(9)2023 09 02.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37697651
2.
Reconstruction of Glutathione Metabolism in the Neuronal Model of Rotenone-Induced Neurodegeneration Using Mass Isotopologue Analysis with Hydrophilic Interaction Liquid Chromatography-Zeno High-Resolution Multiple Reaction Monitoring.
Anal Chem
; 95(6): 3255-3266, 2023 02 14.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36735349
3.
MetaboAnnotator: an efficient toolbox to annotate metabolites in genome-scale metabolic reconstructions.
Bioinformatics
; 38(20): 4831-4832, 2022 10 14.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36047841
4.
DEMETER: efficient simultaneous curation of genome-scale reconstructions guided by experimental data and refined gene annotations.
Bioinformatics
; 37(21): 3974-3975, 2021 11 05.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34473240
5.
Community-driven roadmap for integrated disease maps.
Brief Bioinform
; 20(2): 659-670, 2019 03 25.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29688273
6.
Personalized whole-body models integrate metabolism, physiology, and the gut microbiome.
Mol Syst Biol
; 16(5): e8982, 2020 05.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32463598
7.
The Virtual Metabolic Human database: integrating human and gut microbiome metabolism with nutrition and disease.
Nucleic Acids Res
; 47(D1): D614-D624, 2019 01 08.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30371894
8.
The Microbiome Modeling Toolbox: from microbial interactions to personalized microbial communities.
Bioinformatics
; 35(13): 2332-2334, 2019 07 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30462168
9.
Structural conserved moiety splitting of a stoichiometric matrix.
J Theor Biol
; 499: 110276, 2020 08 21.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32333975
10.
Metabolic and signalling network maps integration: application to cross-talk studies and omics data analysis in cancer.
BMC Bioinformatics
; 20(Suppl 4): 140, 2019 Apr 18.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30999838
11.
DistributedFBA.jl: high-level, high-performance flux balance analysis in Julia.
Bioinformatics
; 33(9): 1421-1423, 2017 05 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28453682
12.
CHRR: coordinate hit-and-run with rounding for uniform sampling of constraint-based models.
Bioinformatics
; 33(11): 1741-1743, 2017 Jun 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28158334
13.
ReconMap: an interactive visualization of human metabolism.
Bioinformatics
; 33(4): 605-607, 2017 02 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-27993782
14.
A systems approach reveals distinct metabolic strategies among the NCI-60 cancer cell lines.
PLoS Comput Biol
; 13(8): e1005698, 2017 Aug.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28806730
15.
Identification of Conserved Moieties in Metabolic Networks by Graph Theoretical Analysis of Atom Transition Networks.
PLoS Comput Biol
; 12(11): e1004999, 2016 Nov.
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en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-27870845
16.
Conditions for duality between fluxes and concentrations in biochemical networks.
J Theor Biol
; 409: 1-10, 2016 11 21.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-27345817
17.
fastGapFill: efficient gap filling in metabolic networks.
Bioinformatics
; 30(17): 2529-31, 2014 Sep 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-24812336
18.
Consistent estimation of Gibbs energy using component contributions.
PLoS Comput Biol
; 9(7): e1003098, 2013.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-23874165
19.
Robust flux balance analysis of multiscale biochemical reaction networks.
BMC Bioinformatics
; 14: 240, 2013 Jul 30.
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| MEDLINE | ID: mdl-23899245
20.
Genome-scale metabolic reconstruction of 7,302 human microorganisms for personalized medicine.
Nat Biotechnol
; 41(9): 1320-1331, 2023 09.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-36658342