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1.
Internal Normal Mode Analysis Applied to RNA Flexibility and Conformational Changes.
J Chem Inf Model
; 63(8): 2554-2572, 2023 04 24.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36972178
2.
Using normal mode analysis on protein structural models. How far can we go on our predictions?
Proteins
; 89(5): 531-543, 2021 05.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33349977
3.
A Bit Stickier, a Bit Slower, a Lot Stiffer: Specific vs. Nonspecific Binding of Gal4 to DNA.
Int J Mol Sci
; 22(8)2021 Apr 07.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33916983
4.
Endoglin Is an Endothelial Housekeeper against Inflammation: Insight in ECFC-Related Permeability through LIMK/Cofilin Pathway.
Int J Mol Sci
; 22(16)2021 Aug 17.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34445542
5.
The interplay between molecular flexibility and RNA chemical probing reactivities analyzed at the nucleotide level via an extensive molecular dynamics study.
Methods
; 162-163: 108-127, 2019 06 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31145972
6.
Density functional theory of nematic elasticity: softening from the polar order.
Soft Matter
; 12(23): 5188-98, 2016 Jun 21.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-27198729
7.
Linker dependent chirality of solvent induced self-assembled structures of porphyrin-α-helical peptide conjugates.
Org Biomol Chem
; 14(40): 9568-9577, 2016 Oct 12.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-27722414
8.
From the molecular structure to spectroscopic and material properties: computational investigation of a bent-core nematic liquid crystal.
Chemphyschem
; 15(7): 1336-44, 2014 May 19.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-24470302
9.
Self-assembly of hard helices: a rich and unconventional polymorphism.
Soft Matter
; 10(41): 8171-87, 2014 Nov 07.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-25164281
10.
Left or right cholesterics? A matter of helix handedness and curliness.
Phys Chem Chem Phys
; 16(30): 16225-32, 2014 Aug 14.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-24969095
11.
Communication: from rods to helices: evidence of a screw-like nematic phase.
J Chem Phys
; 140(8): 081101, 2014 Feb 28.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-24588140
12.
Molecular Origin of Distinct Hydration Dynamics in Double Helical DNA and RNA Sequences.
J Phys Chem Lett
; 15(16): 4351-4358, 2024 Apr 25.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38619551
13.
Dynamics of Protein-RNA Interfaces Using All-Atom Molecular Dynamics Simulations.
J Phys Chem B
; 128(20): 4865-4886, 2024 May 23.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38740056
14.
The isotropic-to-nematic phase transition in hard helices: theory and simulation.
J Chem Phys
; 138(16): 164906, 2013 Apr 28.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-23635170
15.
The interplay of configuration and conformation in helical perylenequinones: Insights from chirality induction in liquid crystals and calculations.
Beilstein J Org Chem
; 8: 155-63, 2012.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-22423282
16.
A dynamical view of protein-protein complexes: Studies by molecular dynamics simulations.
Front Mol Biosci
; 9: 970109, 2022.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36275619
17.
Biasing RNA Coarse-Grained Folding Simulations with Small-Angle X-ray Scattering Data.
J Chem Theory Comput
; 17(10): 6509-6521, 2021 Oct 12.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34506136
18.
Progress toward SHAPE Constrained Computational Prediction of Tertiary Interactions in RNA Structure.
Noncoding RNA
; 7(4)2021 Nov 05.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-34842779
19.
Modelling the active SARS-CoV-2 helicase complex as a basis for structure-based inhibitor design.
Chem Sci
; 12(40): 13492-13505, 2021 Oct 20.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34777769
20.
Induced forms of α2-macroglobulin neutralize heparin and direct oral anticoagulant effects.
Int J Biol Macromol
; 184: 209-217, 2021 Aug 01.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-34126147