Detalles de la búsqueda
1.
Resource allocation modeling for autonomous prediction of plant cell phenotypes.
Metab Eng
; 83: 86-101, 2024 May.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38561149
2.
Stochastic models of regulation of transcription in biological cells.
J Math Biol
; 87(5): 65, 2023 09 29.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37775568
3.
BiPOm: a rule-based ontology to represent and infer molecule knowledge from a biological process-centered viewpoint.
BMC Bioinformatics
; 21(1): 327, 2020 Jul 23.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32703160
4.
Automated generation of bacterial resource allocation models.
Metab Eng
; 55: 12-22, 2019 09.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31189086
5.
Resource allocation in living organisms.
Biochem Soc Trans
; 45(4): 945-952, 2017 08 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28687715
6.
Translation elicits a growth rate-dependent, genome-wide, differential protein production in Bacillus subtilis.
Mol Syst Biol
; 12(5): 870, 2016 05 17.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-27193784
7.
Optimal resource allocation enables mathematical exploration of microbial metabolic configurations.
J Math Biol
; 75(6-7): 1349-1380, 2017 12.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28361242
8.
A stochastic analysis of autoregulation of gene expression.
J Math Biol
; 75(5): 1253-1283, 2017 11.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28289838
9.
Highly precise quantification of protein molecules per cell during stress and starvation responses in Bacillus subtilis.
Mol Cell Proteomics
; 13(9): 2260-76, 2014 Sep.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-24878497
10.
Comprehensive absolute quantification of the cytosolic proteome of Bacillus subtilis by data independent, parallel fragmentation in liquid chromatography/mass spectrometry (LC/MS(E)).
Mol Cell Proteomics
; 13(4): 1008-19, 2014 Apr.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-24696501
11.
Quantitative prediction of genome-wide resource allocation in bacteria.
Metab Eng
; 32: 232-243, 2015 Nov.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-26498510
12.
BasyLiCA: a tool for automatic processing of a Bacterial Live Cell Array.
Bioinformatics
; 28(20): 2705-6, 2012 Oct 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-22764159
13.
A comparative transcriptomic, fluxomic and metabolomic analysis of the response of Saccharomyces cerevisiae to increases in NADPH oxidation.
BMC Genomics
; 13: 317, 2012 Jul 17.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-22805527
14.
A constraint-based model analysis of the metabolic consequences of increased NADPH oxidation in Saccharomyces cerevisiae.
Metab Eng
; 14(4): 366-79, 2012 Jul.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-22709677
15.
An expanded protein-protein interaction network in Bacillus subtilis reveals a group of hubs: Exploration by an integrative approach.
Proteomics
; 11(15): 2981-91, 2011 Aug.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-21630458
16.
BiPSim: a flexible and generic stochastic simulator for polymerization processes.
Sci Rep
; 11(1): 14112, 2021 07 08.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34238958
17.
Thermodynamic Approaches in Flux Analysis.
Methods Mol Biol
; 2088: 359-367, 2020.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31893383
18.
Statistical modelling of bacterial promoter sequences for regulatory motif discovery with the help of transcriptome data: application to Listeria monocytogenes.
J R Soc Interface
; 17(171): 20200600, 2020 10.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33023397
19.
Models of protein production along the cell cycle: An investigation of possible sources of noise.
PLoS One
; 15(1): e0226016, 2020.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31945071
20.
The bacterial interlocked process ONtology (BiPON): a systemic multi-scale unified representation of biological processes in prokaryotes.
J Biomed Semantics
; 8(1): 53, 2017 Nov 23.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-29169408