Detalles de la búsqueda
1.
Estimating maximal microbial growth rates from cultures, metagenomes, and single cells via codon usage patterns.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 118(12)2021 03 23.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33723043
2.
Constraining the composition and quantity of organic matter used by abundant marine Thaumarchaeota.
Environ Microbiol
; 25(3): 689-704, 2023 03.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36478085
3.
Phage-bacterial contig association prediction with a convolutional neural network.
Bioinformatics
; 38(Suppl 1): i45-i52, 2022 06 24.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35758806
4.
A communal catalogue reveals Earth's multiscale microbial diversity.
Nature
; 551(7681): 457-463, 2017 11 23.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29088705
5.
Assessment of metagenomic assemblers based on hybrid reads of real and simulated metagenomic sequences.
Brief Bioinform
; 21(3): 777-790, 2020 05 21.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30860572
6.
Comprehensive single-PCR 16S and 18S rRNA community analysis validated with mock communities, and estimation of sequencing bias against 18S.
Environ Microbiol
; 23(6): 3240-3250, 2021 06.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33938123
7.
Immune lag is a major cost of prokaryotic adaptive immunity during viral outbreaks.
Proc Biol Sci
; 288(1961): 20211555, 2021 10 27.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34666523
8.
Microbial tropicalization driven by a strengthening western ocean boundary current.
Glob Chang Biol
; 26(10): 5613-5629, 2020 Oct.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32715608
9.
Multi-year dynamics of fine-scale marine cyanobacterial populations are more strongly explained by phage interactions than abiotic, bottom-up factors.
Environ Microbiol
; 21(8): 2948-2963, 2019 08.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31106939
10.
A non-tailed twist in the viral tale.
Nature
; 554(7690): 38-39, 2018 Feb.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32094830
11.
A non-tailed twist in the viral tale.
Nature
; 554(7690): 38-39, 2018 02 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29388959
12.
Towards enhanced and interpretable clustering/classification in integrative genomics.
Nucleic Acids Res
; 45(20): e169, 2017 Nov 16.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28977511
13.
CAFE: aCcelerated Alignment-FrEe sequence analysis.
Nucleic Acids Res
; 45(W1): W554-W559, 2017 07 03.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28472388
14.
Alignment-free $d_2
Nucleic Acids Res
; 45(1): 39-53, 2017 01 09.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-27899557
15.
Mosaic patterns of B-vitamin synthesis and utilization in a natural marine microbial community.
Environ Microbiol
; 20(8): 2809-2823, 2018 08.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29659156
16.
Corrigendum to: Assessment of metagenomic assemblers based on hybrid reads of real and simulated metagenomic sequences.
Brief Bioinform
; 22(1): 611, 2021 01 18.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32379299
17.
COCACOLA: binning metagenomic contigs using sequence COmposition, read CoverAge, CO-alignment and paired-end read LinkAge.
Bioinformatics
; 33(6): 791-798, 2017 03 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-27256312
18.
Vertical and Seasonal Patterns Control Bacterioplankton Communities at Two Horizontally Coherent Coastal Upwelling Sites off Galicia (NW Spain).
Microb Ecol
; 76(4): 866-884, 2018 Nov.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29675703
19.
Prediction of virus-host infectious association by supervised learning methods.
BMC Bioinformatics
; 18(Suppl 3): 60, 2017 Mar 14.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28361670
20.
Genome and epigenome of a novel marine Thaumarchaeota strain suggest viral infection, phosphorothioation DNA modification and multiple restriction systems.
Environ Microbiol
; 19(6): 2434-2452, 2017 06.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-28418097