Detalles de la búsqueda
1.
Exact median-tree inference for unrooted reconciliation costs.
BMC Evol Biol
; 20(Suppl 1): 136, 2020 10 28.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33115401
2.
Inferring duplication episodes from unrooted gene trees.
BMC Genomics
; 19(Suppl 5): 288, 2018 May 08.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29745844
3.
Genomic duplication problems for unrooted gene trees.
BMC Genomics
; 17 Suppl 1: 15, 2016 Jan 11.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-26818591
4.
Refining discordant gene trees.
BMC Bioinformatics
; 15 Suppl 13: S3, 2014.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-25434729
5.
Unifying duplication episode clustering and gene-species mapping inference.
Algorithms Mol Biol
; 19(1): 7, 2024 Feb 14.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38355611
6.
Asymmetric Cluster-Based Measures for Comparative Phylogenetics.
J Comput Biol
; 31(4): 312-327, 2024 04.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38634854
7.
Algorithms: simultaneous error-correction and rooting for gene tree reconciliation and the gene duplication problem.
BMC Bioinformatics
; 13 Suppl 10: S14, 2012 Jun 25.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-22759419
8.
Embedding gene trees into phylogenetic networks by conflict resolution algorithms.
Algorithms Mol Biol
; 17(1): 11, 2022 May 19.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35590416
9.
Maximum likelihood models and algorithms for gene tree evolution with duplications and losses.
BMC Bioinformatics
; 12 Suppl 1: S15, 2011 Feb 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-21342544
10.
The Unconstrained Diameters of the Duplication-Loss Cost and the Loss Cost.
IEEE/ACM Trans Comput Biol Bioinform
; 18(6): 2125-2135, 2021.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31150345
11.
Taming the Duplication-Loss-Coalescence Model with Integer Linear Programming.
J Comput Biol
; 28(8): 758-773, 2021 08.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34125600
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Minimizing genomic duplication episodes.
Comput Biol Chem
; 89: 107260, 2020 Dec.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33038778
13.
Inferring phylogeny from whole genomes.
Bioinformatics
; 23(2): e116-22, 2007 Jan 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-17237078
14.
URec: a system for unrooted reconciliation.
Bioinformatics
; 23(4): 511-2, 2007 Feb 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-17182699
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Bijective Diameters of Gene Tree Parsimony Costs.
IEEE/ACM Trans Comput Biol Bioinform
; 15(5): 1723-1727, 2018.
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| MEDLINE | ID: mdl-28792904
16.
Credibility of Evolutionary Events in Gene Trees.
IEEE/ACM Trans Comput Biol Bioinform
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Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29990287
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Efficient Algorithms for Genomic Duplication Models.
IEEE/ACM Trans Comput Biol Bioinform
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Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28541223
18.
Minimizing the deep coalescence cost.
J Bioinform Comput Biol
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Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30419782
19.
Inferring Gene-Species Assignments in the Presence of Horizontal Gene Transfer.
IEEE/ACM Trans Comput Biol Bioinform
; 15(5): 1571-1578, 2018.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28541905
20.
Locus-aware decomposition of gene trees with respect to polytomous species trees.
Algorithms Mol Biol
; 13: 11, 2018.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29881445