Detalles de la búsqueda
1.
ATLAS: protein flexibility description from atomistic molecular dynamics simulations.
Nucleic Acids Res
; 52(D1): D384-D392, 2024 Jan 05.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37986215
2.
Poincaré maps for visualization of large protein families.
Brief Bioinform
; 24(3)2023 05 19.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36946414
3.
Intergenic ORFs as elementary structural modules of de novo gene birth and protein evolution.
Genome Res
; 31(12): 2303-2315, 2021 Dec.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34810219
4.
ICARUS: flexible protein structural alignment based on Protein Units.
Bioinformatics
; 39(8)2023 08 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37498544
5.
SWORD2: hierarchical analysis of protein 3D structures.
Nucleic Acids Res
; 50(W1): W732-W738, 2022 07 05.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35580056
6.
Molecular and structural characterization of a novel high-prevalence antigen of the Augustine blood group system.
Transfusion
; 63(3): 610-618, 2023 03.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36744388
7.
Insights into Comparative Modeling of VHH Domains.
Int J Mol Sci
; 22(18)2021 Sep 09.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34575931
8.
PYTHIA: Deep Learning Approach for Local Protein Conformation Prediction.
Int J Mol Sci
; 22(16)2021 Aug 17.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34445537
9.
A structural entropy index to analyse local conformations in intrinsically disordered proteins.
J Struct Biol
; 210(1): 107464, 2020 04 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31978465
10.
KNOTTIN: the database of inhibitor cystine knot scaffold after 10 years, toward a systematic structure modeling.
Nucleic Acids Res
; 46(D1): D454-D458, 2018 01 04.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29136213
11.
OREMPRO web server: orientation and assessment of atomistic and coarse-grained structures of membrane proteins.
Bioinformatics
; 32(16): 2548-50, 2016 08 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-27153644
12.
Recent advances on polyproline II.
Amino Acids
; 49(4): 705-713, 2017 04.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28185014
13.
Improving protein fold recognition with hybrid profiles combining sequence and structure evolution.
Bioinformatics
; 31(23): 3782-9, 2015 Dec 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-26254434
14.
Bioinformatic analysis of the protein/DNA interface.
Nucleic Acids Res
; 42(5): 3381-94, 2014 Mar.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-24335080
15.
Local dynamics of proteins and DNA evaluated from crystallographic B factors.
Acta Crystallogr D Biol Crystallogr
; 70(Pt 9): 2413-9, 2014 Sep.
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| MEDLINE | ID: mdl-25195754
16.
PredyFlexy: flexibility and local structure prediction from sequence.
Nucleic Acids Res
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| MEDLINE | ID: mdl-22689641
17.
MitoGenesisDB: an expression data mining tool to explore spatio-temporal dynamics of mitochondrial biogenesis.
Nucleic Acids Res
; 39(Database issue): D1079-84, 2011 Jan.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-20833631
18.
iPBA: a tool for protein structure comparison using sequence alignment strategies.
Nucleic Acids Res
; 39(Web Server issue): W18-23, 2011 Jul.
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| MEDLINE | ID: mdl-21586582
19.
Quality assessment of VHH models.
J Biomol Struct Dyn
; 41(22): 13287-13301, 2023.
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| MEDLINE | ID: mdl-36752327
20.
Protein Peeling 3D: new tools for analyzing protein structures.
Bioinformatics
; 27(1): 132-3, 2011 Jan 01.
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| MEDLINE | ID: mdl-21075745