Detalles de la búsqueda
1.
Quantifying shifts in natural selection on codon usage between protein regions: a population genetics approach.
BMC Genomics
; 23(1): 408, 2022 May 30.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35637464
2.
A Spatially Explicit Model of Stabilizing Selection for Improving Phylogenetic Inference.
Mol Biol Evol
; 38(4): 1641-1652, 2021 04 13.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33306127
3.
Unlocking a signal of introgression from codons in Lachancea kluyveri using a mutation-selection model.
BMC Evol Biol
; 20(1): 109, 2020 08 26.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-32842959
4.
Gene expression of functionally-related genes coevolves across fungal species: detecting coevolution of gene expression using phylogenetic comparative methods.
BMC Genomics
; 21(1): 370, 2020 May 20.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-32434474
5.
Population Genetics Based Phylogenetics Under Stabilizing Selection for an Optimal Amino Acid Sequence: A Nested Modeling Approach.
Mol Biol Evol
; 36(4): 834-851, 2019 04 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30521036
6.
AnaCoDa: analyzing codon data with Bayesian mixture models.
Bioinformatics
; 34(14): 2496-2498, 2018 07 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29522124
7.
A codon model of nucleotide substitution with selection on synonymous codon usage.
Mol Phylogenet Evol
; 94(Pt A): 290-7, 2016 Jan.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-26358614
8.
Evidence for finely-regulated asynchronous growth of Toxoplasma gondii cysts based on data-driven model selection.
PLoS Comput Biol
; 9(11): e1003283, 2013.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-24244117
9.
Explaining complex codon usage patterns with selection for translational efficiency, mutation bias, and genetic drift.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 108(25): 10231-6, 2011 Jun 21.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-21646514
10.
Profiling expression strategies for a type III polyketide synthase in a lysate-based, cell-free system.
Sci Rep
; 14(1): 12983, 2024 06 06.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38839808
11.
Effect of correlated tRNA abundances on translation errors and evolution of codon usage bias.
PLoS Genet
; 6(9): e1001128, 2010 Sep 16.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-20862306
12.
Profiling Expression Strategies for a Type III Polyketide Synthase in a Lysate-Based, Cell-free System.
bioRxiv
; 2023 Dec 01.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-38077034
13.
The h subunit of eIF3 promotes reinitiation competence during translation of mRNAs harboring upstream open reading frames.
RNA
; 16(4): 748-61, 2010 Apr.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-20179149
14.
Memory T cells are enriched in lymph nodes of selectin-ligand-deficient mice.
J Immunol
; 185(10): 5751-61, 2010 Nov 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-20937846
15.
Bias correction and Bayesian analysis of aggregate counts in SAGE libraries.
BMC Bioinformatics
; 11: 72, 2010 Feb 03.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-20128916
16.
Quantifying codon usage in signal peptides: Gene expression and amino acid usage explain apparent selection for inefficient codons.
Biochim Biophys Acta Biomembr
; 1860(12): 2479-2485, 2018 12.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-30279149
17.
Modeling SAGE tag formation and its effects on data interpretation within a Bayesian framework.
BMC Bioinformatics
; 8: 403, 2007 Oct 18.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-17945026
18.
Identifying fitness and optimal life-history strategies for an asexual filamentous fungus.
Evolution
; 60(5): 970-9, 2006 May.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-16817537
19.
Estimating Gene Expression and Codon-Specific Translational Efficiencies, Mutation Biases, and Selection Coefficients from Genomic Data Alone.
Genome Biol Evol
; 7(6): 1559-79, 2015 May 14.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-25977456
20.
Calibrating a molecular clock from phylogeographic data: moments and likelihood estimators.
Evolution
; 57(10): 2216-25, 2003 Oct.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-14628910