Detalles de la búsqueda
1.
RNA-Puzzles Round IV: 3D structure predictions of four ribozymes and two aptamers.
RNA
; 26(8): 982-995, 2020 08.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-32371455
2.
Divalent Metal Ion Activation of a Guanine General Base in the Hammerhead Ribozyme: Insights from Molecular Simulations.
Biochemistry
; 56(24): 2985-2994, 2017 06 20.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-28530384
3.
Two Active Site Divalent Ions in the Crystal Structure of the Hammerhead Ribozyme Bound to a Transition State Analogue.
Biochemistry
; 55(4): 633-6, 2016 Feb 02.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-26551631
4.
Two Divalent Metal Ions and Conformational Changes Play Roles in the Hammerhead Ribozyme Cleavage Reaction.
Biochemistry
; 54(41): 6369-81, 2015 Oct 20.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-26398724
5.
PICKLE is a CHD subfamily II ATP-dependent chromatin remodeling factor.
Biochim Biophys Acta
; 1829(2): 199-210, 2013 Feb.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-23128324
6.
Structure of a tyrosyl-tRNA synthetase splicing factor bound to a group I intron RNA.
Nature
; 451(7174): 94-7, 2008 Jan 03.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-18172503
7.
Identification of the catalytic Mg²âº ion in the hepatitis delta virus ribozyme.
Biochemistry
; 52(3): 557-67, 2013 Jan 22.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-23311293
8.
Thio effects and an unconventional metal ion rescue in the genomic hepatitis delta virus ribozyme.
Biochemistry
; 52(37): 6499-514, 2013 Sep 17.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-24001219
9.
RNA molecules with conserved catalytic cores but variable peripheries fold along unique energetically optimized pathways.
RNA
; 17(8): 1589-603, 2011 Aug.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-21712400
10.
Identification and characterization of anion binding sites in RNA.
RNA
; 16(6): 1118-23, 2010 Jun.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-20410239
11.
Two distinct catalytic strategies in the hepatitis δ virus ribozyme cleavage reaction.
Biochemistry
; 50(44): 9424-33, 2011 Nov 08.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-22003985
12.
Metal binding motif in the active site of the HDV ribozyme binds divalent and monovalent ions.
Biochemistry
; 50(13): 2672-82, 2011 Apr 05.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-21348498
13.
A 1.9 A crystal structure of the HDV ribozyme precleavage suggests both Lewis acid and general acid mechanisms contribute to phosphodiester cleavage.
Biochemistry
; 49(31): 6508-18, 2010 Aug 10.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-20677830
14.
Mechanistic characterization of the HDV genomic ribozyme: the cleavage site base pair plays a structural role in facilitating catalysis.
RNA
; 14(9): 1746-60, 2008 Sep.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-18658121
15.
Crystal structure of a phage Twort group I ribozyme-product complex.
Nat Struct Mol Biol
; 12(1): 82-9, 2005 Jan.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-15580277
16.
Raman crystallography of RNA.
Methods
; 49(2): 101-11, 2009 Oct.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-19409996
17.
A catalytic metal ion interacts with the cleavage Site G.U wobble in the HDV ribozyme.
Biochemistry
; 48(7): 1498-507, 2009 Feb 24.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-19178151
18.
Competition between Co(NH(3)(6)3+ and inner sphere Mg2+ ions in the HDV ribozyme.
Biochemistry
; 48(50): 11961-70, 2009 Dec 22.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-19888753
19.
Role of sindbis virus capsid protein region II in nucleocapsid core assembly and encapsidation of genomic RNA.
J Virol
; 82(9): 4461-70, 2008 May.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-18305029
20.
Detection of innersphere interactions between magnesium hydrate and the phosphate backbone of the HDV ribozyme using Raman crystallography.
J Am Chem Soc
; 130(30): 9670-2, 2008 Jul 30.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-18593125