Detalles de la búsqueda
1.
Landscape of circRNAs Across 11 Organs and 4 Ages in Fischer 344 Rats.
Chem Res Toxicol
; 34(2): 240-246, 2021 02 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32692164
2.
Impact of Sequencing Depth and Library Preparation on Toxicological Interpretation of RNA-Seq Data in a "Three-Sample" Scenario.
Chem Res Toxicol
; 34(2): 529-540, 2021 02 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33354967
3.
Discovering functional modules by topic modeling RNA-Seq based toxicogenomic data.
Chem Res Toxicol
; 27(9): 1528-36, 2014 Sep 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-25083553
4.
Towards accurate indel calling for oncopanel sequencing through an international pipeline competition at precisionFDA.
Sci Rep
; 14(1): 8165, 2024 04 08.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38589653
5.
Extend the benchmarking indel set by manual review using the individual cell line sequencing data from the Sequencing Quality Control 2 (SEQC2) project.
Sci Rep
; 14(1): 7028, 2024 03 25.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38528062
6.
Combined gene expression and protein interaction analysis of dynamic modularity in glioma prognosis.
J Neurooncol
; 107(2): 281-8, 2012 Apr.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-22071792
7.
Ultra-deep multi-oncopanel sequencing of benchmarking samples with a wide range of variant allele frequencies.
Sci Data
; 9(1): 288, 2022 06 09.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35680918
8.
Ultra-deep sequencing data from a liquid biopsy proficiency study demonstrating analytic validity.
Sci Data
; 9(1): 170, 2022 04 13.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35418127
9.
Deep oncopanel sequencing reveals within block position-dependent quality degradation in FFPE processed samples.
Genome Biol
; 23(1): 141, 2022 06 29.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35768876
10.
DOSim: an R package for similarity between diseases based on Disease Ontology.
BMC Bioinformatics
; 12: 266, 2011 Jun 29.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-21714896
11.
Disease embryo development network reveals the relationship between disease genes and embryo development genes.
J Theor Biol
; 287: 100-8, 2011 Oct 21.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-21824480
12.
SubpathwayMiner: a software package for flexible identification of pathways.
Nucleic Acids Res
; 37(19): e131, 2009 Oct.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-19706733
13.
CarcSeq Measurement of Rat Mammary Cancer Driver Mutations and Relation to Spontaneous Mammary Neoplasia.
Toxicol Sci
; 182(1): 142-158, 2021 07 16.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33822199
14.
Assessment of Clonal Expansion Using CarcSeq Measurement of Lung Cancer Driver Mutations and Correlation With Mouse Strain- and Sex-Related Incidence of Spontaneous Lung Neoplasia.
Toxicol Sci
; 184(1): 1-14, 2021 10 27.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34373914
15.
Identification of Translational microRNA Biomarker Candidates for Ketoconazole-Induced Liver Injury Using Next-Generation Sequencing.
Toxicol Sci
; 179(1): 31-43, 2021 01 06.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33078836
16.
Cross-oncopanel study reveals high sensitivity and accuracy with overall analytical performance depending on genomic regions.
Genome Biol
; 22(1): 109, 2021 04 16.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33863344
17.
A verified genomic reference sample for assessing performance of cancer panels detecting small variants of low allele frequency.
Genome Biol
; 22(1): 111, 2021 04 16.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33863366
18.
Evaluating the analytical validity of circulating tumor DNA sequencing assays for precision oncology.
Nat Biotechnol
; 39(9): 1115-1128, 2021 09.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33846644
19.
Quantification of cancer driver mutations in human breast and lung DNA using targeted, error-corrected CarcSeq.
Environ Mol Mutagen
; 61(9): 872-889, 2020 11.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32940377
20.
Application of microRNA profiling to understand sevoflurane-induced adverse effects on developing monkey brain.
Neurotoxicology
; 81: 172-179, 2020 12.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33045284