Detalles de la búsqueda
1.
Assessment of Embedding Schemes in a Hybrid Machine Learning/Classical Potentials (ML/MM) Approach.
J Chem Inf Model
; 64(10): 4047-4058, 2024 May 27.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38710065
2.
Short hydrogen bonds enhance nonaromatic protein-related fluorescence.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 118(21)2021 05 25.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34001606
3.
Dissipative Equation of Motion for Electromagnetic Radiation in Quantum Dynamics.
Phys Rev Lett
; 126(8): 087401, 2021 Feb 26.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33709735
4.
Spectroscopy in Complex Environments from QM-MM Simulations.
Chem Rev
; 118(7): 4071-4113, 2018 04 11.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29561145
5.
Fluorescence Quantum Yields in Complex Environments from QM-MM TDDFT Simulations: The Case of Indole in Different Solvents.
J Phys Chem A
; 124(46): 9503-9512, 2020 Nov 19.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33166141
6.
Electron transport in real time from first-principles.
J Chem Phys
; 146(4): 044110, 2017 01 28.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28147541
7.
Mechanism of cysteine oxidation by peroxynitrite: An integrated experimental and theoretical study.
Arch Biochem Biophys
; 539(1): 81-6, 2013 Nov 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-24012807
8.
The carbonyl-lock mechanism underlying non-aromatic fluorescence in biological matter.
Nat Commun
; 14(1): 7325, 2023 11 13.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37957206
9.
Remodelling the surface of thioredoxin from Escherichia coli by grafting an iron-binding site from the CyaY protein family.
Dalton Trans
; 51(46): 17587-17601, 2022 Nov 29.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36345601
10.
Non-Aromatic Fluorescence in Biological Matter: The Exception or the Rule?
J Phys Chem B
; 126(38): 7203-7211, 2022 09 29.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36128666
11.
Gain of local structure in an amphipathic peptide does not require a specific tertiary framework.
Proteins
; 78(13): 2757-68, 2010 Oct.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-20607854
12.
Transport and Spectroscopy in Conjugated Molecules: Two Properties and a Single Rationale.
J Chem Theory Comput
; 16(5): 2930-2940, 2020 May 12.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32259442
13.
Reaction Path Analysis from Potential Energy Contributions Using Forces: An Accessible Estimator of Reaction Coordinate Adequacy.
J Chem Theory Comput
; 16(3): 1618-1629, 2020 Mar 10.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31999449
14.
Bond or cage effect: how nitrophorins transport and release nitric oxide.
J Am Chem Soc
; 130(5): 1611-8, 2008 Feb 06.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-18189390
15.
Chemical Reactivity and Spectroscopy Explored From QM/MM Molecular Dynamics Simulations Using the LIO Code.
Front Chem
; 6: 70, 2018.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29619365
16.
Role of Core Electrons in Quantum Dynamics Using TDDFT.
J Chem Theory Comput
; 13(1): 77-85, 2017 01 10.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-27957843
17.
Theoretical Insights into the Reaction and Inhibition Mechanism of Metal-Independent Retaining Glycosyltransferase Responsible for Mycothiol Biosynthesis.
J Phys Chem B
; 121(3): 471-478, 2017 01 26.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-27935720
18.
A helix-coil transition induced by the metal ion interaction with a grafted iron-binding site of the CyaY protein family.
Dalton Trans
; 44(5): 2370-9, 2015 Feb 07.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-25533527
19.
GPU Accelerated Implementation of Density Functional Theory for Hybrid QM/MM Simulations.
J Chem Theory Comput
; 10(3): 959-67, 2014 Mar 11.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-26580175
20.
QM-MM Investigation of the Reaction of Peroxynitrite with Carbon Dioxide in Water.
J Chem Theory Comput
; 3(4): 1405-11, 2007 Jul.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-26633212