Detalles de la búsqueda
1.
Reliable method for predicting the binding affinity of RNA-small molecule interactions using machine learning.
Brief Bioinform
; 25(2)2024 Jan 22.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38261341
2.
TMKit: a Python interface for computational analysis of transmembrane proteins.
Brief Bioinform
; 24(5)2023 09 20.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37594311
3.
DeepPPAPredMut: deep ensemble method for predicting the binding affinity change in protein-protein complexes upon mutation.
Bioinformatics
; 40(5)2024 May 02.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-38718170
4.
MPA-Pred: A machine learning approach for predicting the binding affinity of membrane protein-protein complexes.
Proteins
; 92(4): 499-508, 2024 Apr.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37949651
5.
CarbDisMut: database on neutral and disease-causing mutations in human carbohydrate-binding proteins.
Glycobiology
; 34(4)2024 Apr 10.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-38335248
6.
Identification of potential driver mutations in glioblastoma using machine learning.
Brief Bioinform
; 23(6)2022 11 19.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36266243
7.
ProNAB: database for binding affinities of protein-nucleic acid complexes and their mutants.
Nucleic Acids Res
; 50(D1): D1528-D1534, 2022 01 07.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34606614
8.
MPTherm: database for membrane protein thermodynamics for understanding folding and stability.
Brief Bioinform
; 22(2): 2119-2125, 2021 03 22.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32337573
9.
Evaluation of in silico tools for the prediction of protein and peptide aggregation on diverse datasets.
Brief Bioinform
; 22(6)2021 11 05.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34181000
10.
Prediction of protein-carbohydrate complex binding affinity using structural features.
Brief Bioinform
; 22(4)2021 07 20.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33313775
11.
Mutations in transmembrane proteins: diseases, evolutionary insights, prediction and comparison with globular proteins.
Brief Bioinform
; 22(3)2021 05 20.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32672331
12.
Ab-CoV: a curated database for binding affinity and neutralization profiles of coronavirus-related antibodies.
Bioinformatics
; 38(16): 4051-4052, 2022 08 10.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35771624
13.
In silico evaluation of the impact of Omicron variant of concern sublineage BA.4 and BA.5 on the sensitivity of RT-qPCR assays for SARS-CoV-2 detection using whole genome sequencing.
J Med Virol
; 95(1): e28241, 2023 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36263448
14.
DeepBSRPred: deep learning-based binding site residue prediction for proteins.
Amino Acids
; 55(10): 1305-1316, 2023 Oct.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36574037
15.
ProThermDB: thermodynamic database for proteins and mutants revisited after 15 years.
Nucleic Acids Res
; 49(D1): D420-D424, 2021 01 08.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33196841
16.
Effect of charged mutation on aggregation of a pentapeptide: Insights from molecular dynamics simulations.
Proteins
; 90(2): 405-417, 2022 02.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34460128
17.
Elucidating important structural features for the binding affinity of spike - SARS-CoV-2 neutralizing antibody complexes.
Proteins
; 90(3): 824-834, 2022 03.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-34761442
18.
Tackling Covid-19 using disordered-to-order transition of residues in the spike protein upon angiotensin-converting enzyme 2 binding.
Proteins
; 89(9): 1158-1166, 2021 09.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33893649
19.
Why are ACE2 binding coronavirus strains SARS-CoV/SARS-CoV-2 wild and NL63 mild?
Proteins
; 89(4): 389-398, 2021 04.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-33210300
20.
ProAffiMuSeq: sequence-based method to predict the binding free energy change of protein-protein complexes upon mutation using functional classification.
Bioinformatics
; 36(6): 1725-1730, 2020 03 01.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-31713585