Detalles de la búsqueda
1.
Macromolecular modeling and design in Rosetta: recent methods and frameworks.
Nat Methods
; 17(7): 665-680, 2020 07.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32483333
2.
VisuaLife: library for interactive visualization in rich web applications.
Bioinformatics
; 37(20): 3662-3663, 2021 Oct 25.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33961033
3.
Contrasting Health Effects of Bacteroidetes and Firmicutes Lies in Their Genomes: Analysis of P450s, Ferredoxins, and Secondary Metabolite Clusters.
Int J Mol Sci
; 23(9)2022 May 02.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35563448
4.
Lifestyles Shape the Cytochrome P450 Repertoire of the Bacterial Phylum Proteobacteria.
Int J Mol Sci
; 23(10)2022 May 22.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35628630
5.
Diversification of Ferredoxins across Living Organisms.
Curr Issues Mol Biol
; 43(3): 1374-1390, 2021 Sep 30.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34698119
6.
Better together: Elements of successful scientific software development in a distributed collaborative community.
PLoS Comput Biol
; 16(5): e1007507, 2020 05.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32365137
7.
In Silico Structural Modeling and Analysis of Interactions of Tremellomycetes Cytochrome P450 Monooxygenases CYP51s with Substrates and Azoles.
Int J Mol Sci
; 22(15)2021 Jul 22.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34360577
8.
Ancient Bacterial Class Alphaproteobacteria Cytochrome P450 Monooxygenases Can Be Found in Other Bacterial Species.
Int J Mol Sci
; 22(11)2021 May 24.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34073951
9.
In Silico Analysis of P450s and Their Role in Secondary Metabolism in the Bacterial Class Gammaproteobacteria.
Molecules
; 26(6)2021 Mar 11.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33799696
10.
Practical Considerations for Atomistic Structure Modeling with Cryo-EM Maps.
J Chem Inf Model
; 60(5): 2436-2442, 2020 05 26.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32422044
11.
More P450s Are Involved in Secondary Metabolite Biosynthesis in Streptomyces Compared to Bacillus, Cyanobacteria, and Mycobacterium.
Int J Mol Sci
; 21(13)2020 Jul 07.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32646068
12.
In silico analysis of cytochrome P450 monooxygenases in chronic granulomatous infectious fungus Sporothrix schenckii: Special focus on CYP51.
Biochim Biophys Acta Proteins Proteom
; 1866(1): 166-177, 2018 Jan.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28989052
13.
Coarse-Grained Protein Models and Their Applications.
Chem Rev
; 116(14): 7898-936, 2016 07 27.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-27333362
14.
BioShell-Threading: versatile Monte Carlo package for protein 3D threading.
BMC Bioinformatics
; 15: 22, 2014 Jan 20.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-24444459
15.
BioShell Threader: protein homology detection based on sequence profiles and secondary structure profiles.
Nucleic Acids Res
; 40(Web Server issue): W257-62, 2012 Jul.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-22693216
16.
Combining coarse-grained protein models with replica-exchange all-atom molecular dynamics.
Int J Mol Sci
; 14(5): 9893-905, 2013 May 10.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-23665897
17.
Coarse-grained potential for hydrogen bond interactions.
J Mol Graph Model
; 124: 108507, 2023 11.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37295157
18.
Assessing the accuracy of template-based structure prediction metaservers by comparison with structural genomics structures.
J Struct Funct Genomics
; 13(4): 213-25, 2012 Dec.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-23086054
19.
Automated Protein Secondary Structure Assignment from Cα Positions Using Neural Networks.
Biomolecules
; 12(6)2022 06 17.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35740966
20.
An Unprecedented Number of Cytochrome P450s Are Involved in Secondary Metabolism in Salinispora Species.
Microorganisms
; 10(5)2022 Apr 21.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35630316