Detalles de la búsqueda
1.
Predicting weighted unobserved nodes in a regulatory network using answer set programming.
BMC Bioinformatics
; 24(Suppl 1): 321, 2023 Aug 25.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37626282
2.
A pipeline to create predictive functional networks: application to the tumor progression of hepatocellular carcinoma.
BMC Bioinformatics
; 21(1): 18, 2020 Jan 14.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31937236
3.
Computational discovery of dynamic cell line specific Boolean networks from multiplex time-course data.
PLoS Comput Biol
; 14(10): e1006538, 2018 10.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30372442
4.
Discriminate the response of Acute Myeloid Leukemia patients to treatment by using proteomics data and Answer Set Programming.
BMC Bioinformatics
; 19(Suppl 2): 59, 2018 03 08.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29536824
5.
caspo: a toolbox for automated reasoning on the response of logical signaling networks families.
Bioinformatics
; 33(6): 947-950, 2017 03 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28065903
6.
Proteomics Versus Clinical Data and Stochastic Local Search Based Feature Selection for Acute Myeloid Leukemia Patients' Classification.
J Med Syst
; 42(7): 129, 2018 Jun 04.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29869179
7.
Deciphering transcriptional regulations coordinating the response to environmental changes.
BMC Bioinformatics
; 17: 35, 2016 Jan 16.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-26772805
8.
Extended notions of sign consistency to relate experimental data to signaling and regulatory network topologies.
BMC Bioinformatics
; 16: 345, 2015 Oct 28.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-26510976
9.
Exhaustively characterizing feasible logic models of a signaling network using Answer Set Programming.
Bioinformatics
; 29(18): 2320-6, 2013 Sep 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-23853063
10.
Boolean Network Models of Human Preimplantation Development.
J Comput Biol
; 2024 May 29.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38814745
11.
BioQuali Cytoscape plugin: analysing the global consistency of regulatory networks.
BMC Genomics
; 10: 244, 2009 May 26.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-19470162
12.
Inferring the role of transcription factors in regulatory networks.
BMC Bioinformatics
; 9: 228, 2008 May 06.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-18460200
13.
Therapeutic target discovery using Boolean network attractors: improvements of kali.
R Soc Open Sci
; 5(2): 171852, 2018 Feb.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29515890
14.
Constraints on signaling network logic reveal functional subgraphs on Multiple Myeloma OMIC data.
BMC Syst Biol
; 12(Suppl 3): 32, 2018 03 21.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29589566
15.
Identification of bifurcation transitions in biological regulatory networks using Answer-Set Programming.
Algorithms Mol Biol
; 12: 19, 2017.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28736575
16.
Logic programming reveals alteration of key transcription factors in multiple myeloma.
Sci Rep
; 7(1): 9257, 2017 08 23.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28835615
17.
JUICE: a data management system that facilitates the analysis of large volumes of information in an EST project workflow.
BMC Bioinformatics
; 7: 513, 2006 Nov 23.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-17123449
18.
Directed random walks and constraint programming reveal active pathways in hepatocyte growth factor signaling.
FEBS J
; 283(2): 350-60, 2016 Jan.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-26518250
19.
Designing Experiments to Discriminate Families of Logic Models.
Front Bioeng Biotechnol
; 3: 131, 2015.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-26389116
20.
Automatic generation of causal networks linking growth factor stimuli to functional cell state changes.
FEBS J
; 279(18): 3462-74, 2012 Sep.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-22540519