Detalles de la búsqueda
1.
Genome-Scale Metabolic Modeling of the Human Microbiome in the Era of Personalized Medicine.
Annu Rev Microbiol
; 75: 199-222, 2021 10 08.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34314593
2.
Systems biology elucidates the distinctive metabolic niche filled by the human gut microbe Eggerthella lenta.
PLoS Biol
; 21(5): e3002125, 2023 05.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37205710
3.
Circulating metabolites modulated by diet are associated with depression.
Mol Psychiatry
; 28(9): 3874-3887, 2023 Sep.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37495887
4.
A structured evaluation of genome-scale constraint-based modeling tools for microbial consortia.
PLoS Comput Biol
; 19(8): e1011363, 2023 08.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37578975
5.
Microbiome Modelling Toolbox 2.0: efficient, tractable modelling of microbiome communities.
Bioinformatics
; 38(8): 2367-2368, 2022 04 12.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35157025
6.
DEMETER: efficient simultaneous curation of genome-scale reconstructions guided by experimental data and refined gene annotations.
Bioinformatics
; 37(21): 3974-3975, 2021 11 05.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34473240
7.
Personalized whole-body models integrate metabolism, physiology, and the gut microbiome.
Mol Syst Biol
; 16(5): e8982, 2020 05.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32463598
8.
The Virtual Metabolic Human database: integrating human and gut microbiome metabolism with nutrition and disease.
Nucleic Acids Res
; 47(D1): D614-D624, 2019 01 08.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30371894
9.
The Microbiome Modeling Toolbox: from microbial interactions to personalized microbial communities.
Bioinformatics
; 35(13): 2332-2334, 2019 07 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30462168
10.
Gut microbiota functions: metabolism of nutrients and other food components.
Eur J Nutr
; 57(1): 1-24, 2018 Feb.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28393285
11.
Anoxic Conditions Promote Species-Specific Mutualism between Gut Microbes In Silico.
Appl Environ Microbiol
; 81(12): 4049-61, 2015 Jun 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-25841013
12.
Functional metabolic map of Faecalibacterium prausnitzii, a beneficial human gut microbe.
J Bacteriol
; 196(18): 3289-302, 2014 Sep.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-25002542
13.
Towards personalized genome-scale modeling of inborn errors of metabolism for systems medicine applications.
Metabolism
; 150: 155738, 2024 Jan.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37981189
14.
A systematic review and meta-analysis of proteomic and metabolomic alterations in anaphylaxis reactions.
Front Immunol
; 15: 1328212, 2024.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38384462
15.
Whole-body metabolic modelling reveals microbiome and genomic interactions on reduced urine formate levels in Alzheimer's disease.
Sci Rep
; 14(1): 6095, 2024 03 13.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38480804
16.
Causal inference on microbiome-metabolome relations in observational host-microbiome data via in silico in vivo association pattern analyses.
Cell Rep Methods
; 3(10): 100615, 2023 Oct 23.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37848031
17.
Longitudinal flux balance analyses of a patient with episodic colonic inflammation reveals microbiome metabolic dynamics.
Gut Microbes
; 15(1): 2226921, 2023.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37438876
18.
Preterm birth is associated with xenobiotics and predicted by the vaginal metabolome.
Nat Microbiol
; 8(2): 246-259, 2023 02.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36635575
19.
Genome-scale metabolic reconstruction of 7,302 human microorganisms for personalized medicine.
Nat Biotechnol
; 41(9): 1320-1331, 2023 09.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36658342
20.
APOLLO: A genome-scale metabolic reconstruction resource of 247,092 diverse human microbes spanning multiple continents, age groups, and body sites.
bioRxiv
; 2023 Oct 03.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-37873072