Detalles de la búsqueda
1.
Repeat turnover meets stable chromosomes: repetitive DNA sequences mark speciation and gene pool boundaries in sugar beet and wild beets.
Plant J
; 118(1): 171-190, 2024 Apr.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38128038
2.
Evolving Together: Cassandra Retrotransposons Gradually Mirror Promoter Mutations of the 5S rRNA Genes.
Mol Biol Evol
; 41(2)2024 Feb 01.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-38262464
3.
The Dynamic Interplay Between Ribosomal DNA and Transposable Elements: A Perspective From Genomics and Cytogenetics.
Mol Biol Evol
; 41(3)2024 Mar 01.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-38306580
4.
How to start a LINE: 5' switching rejuvenates LINE retrotransposons in tobacco and related Nicotiana species.
Plant J
; 115(1): 52-67, 2023 Jul.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-36965091
5.
High-fidelity (repeat) consensus sequences from short reads using combined read clustering and assembly.
BMC Genomics
; 25(1): 109, 2024 Jan 24.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-38267856
6.
ECCsplorer: a pipeline to detect extrachromosomal circular DNA (eccDNA) from next-generation sequencing data.
BMC Bioinformatics
; 23(1): 40, 2022 Jan 14.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-35030991
7.
Complete pan-plastome sequences enable high resolution phylogenetic classification of sugar beet and closely related crop wild relatives.
BMC Genomics
; 23(1): 113, 2022 Feb 10.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-35139817
8.
The conserved 3' Angio-domain defines a superfamily of short interspersed nuclear elements (SINEs) in higher plants.
Plant J
; 101(3): 681-699, 2020 02.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-31610059
9.
Satellite DNA landscapes after allotetraploidization of quinoa (Chenopodium quinoa) reveal unique A and B subgenomes.
Plant J
; 103(1): 32-52, 2020 07.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31981259
10.
Divergence of 3' ends as a driver of short interspersed nuclear element (SINE) evolution in the Salicaceae.
Plant J
; 103(1): 443-458, 2020 07.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-32056333
11.
The Cassandra retrotransposon landscape in sugar beet (Beta vulgaris) and related Amaranthaceae: recombination and re-shuffling lead to a high structural variability.
Ann Bot
; 127(1): 91-109, 2021 01 01.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-33009553
12.
Broken, silent, and in hiding: tamed endogenous pararetroviruses escape elimination from the genome of sugar beet (Beta vulgaris).
Ann Bot
; 128(3): 281-299, 2021 08 26.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-33729490
13.
FlexiDot: highly customizable, ambiguity-aware dotplots for visual sequence analyses.
Bioinformatics
; 34(20): 3575-3577, 2018 10 15.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-29762645
14.
Adding color to a century-old enigma: multi-color chromosome identification unravels the autotriploid nature of saffron (Crocus sativus) as a hybrid of wild Crocus cartwrightianus cytotypes.
New Phytol
; 222(4): 1965-1980, 2019 06.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30690735
15.
Can we have it all? Repurposing target capture for repeat genomics. A commentary on: 'Aiming off the target: recycling target capture sequencing reads for investigating repetitive DNA'.
Ann Bot
; 128(7): iii-v, 2021 11 09.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-34289009
16.
Next-generation sequencing reveals differentially amplified tandem repeats as a major genome component of Northern Europe's oldest Camellia japonica.
Chromosome Res
; 23(4): 791-806, 2015 Dec.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-26582634
17.
Profiling of extensively diversified plant LINEs reveals distinct plant-specific subclades.
Plant J
; 79(3): 385-97, 2014 Aug.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-24862340
18.
The diversification and activity of hAT transposons in Musa genomes.
Chromosome Res
; 22(4): 559-71, 2014 Dec.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-25377178
19.
TE-Tracker: systematic identification of transposition events through whole-genome resequencing.
BMC Bioinformatics
; 15: 377, 2014 Nov 19.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-25408240
20.
Balancing Retrospection and Visions: The Cytogenetics Group of the Society of Plant Breeding (GPZ) Came Together in Dresden.
Cytogenet Genome Res
; 159(4): 163-168, 2019.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-31931500