Detalles de la búsqueda
1.
Quiescent cancer cells resist T cell attack by forming an immunosuppressive niche.
Cell
; 185(10): 1694-1708.e19, 2022 05 12.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35447074
2.
Challenges in unsupervised clustering of single-cell RNA-seq data.
Nat Rev Genet
; 20(5): 273-282, 2019 05.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30617341
3.
Publisher Correction: Challenges in unsupervised clustering of single-cell RNA-seq data.
Nat Rev Genet
; 20(5): 310, 2019 05.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30670832
4.
scHumanNet: a single-cell network analysis platform for the study of cell-type specificity of disease genes.
Nucleic Acids Res
; 51(2): e8, 2023 01 25.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36350625
5.
Integrative analysis of transcriptomic and epigenomic data reveals distinct patterns for developmental and housekeeping gene regulation.
BMC Biol
; 22(1): 78, 2024 Apr 10.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38600550
6.
Fast searches of large collections of single-cell data using scfind.
Nat Methods
; 18(3): 262-271, 2021 03.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33649586
7.
TransposonUltimate: software for transposon classification, annotation and detection.
Nucleic Acids Res
; 50(11): e64, 2022 06 24.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35234904
8.
Souporcell: robust clustering of single-cell RNA-seq data by genotype without reference genotypes.
Nat Methods
; 17(6): 615-620, 2020 06.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32366989
9.
Flexible comparison of batch correction methods for single-cell RNA-seq using BatchBench.
Nucleic Acids Res
; 49(7): e42, 2021 04 19.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33524142
10.
Asymmetron: a toolkit for the identification of strand asymmetry patterns in biological sequences.
Nucleic Acids Res
; 49(1): e4, 2021 01 11.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33211865
11.
SC3s: efficient scaling of single cell consensus clustering to millions of cells.
BMC Bioinformatics
; 23(1): 536, 2022 Dec 12.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36503522
12.
Noncanonical secondary structures arising from non-B DNA motifs are determinants of mutagenesis.
Genome Res
; 28(9): 1264-1271, 2018 09.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30104284
13.
scmap: projection of single-cell RNA-seq data across data sets.
Nat Methods
; 15(5): 359-362, 2018 05.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29608555
14.
Disruption of DNA-methylation-dependent long gene repression in Rett syndrome.
Nature
; 522(7554): 89-93, 2015 Jun 04.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-25762136
15.
SC3: consensus clustering of single-cell RNA-seq data.
Nat Methods
; 14(5): 483-486, 2017 May.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28346451
16.
M3Drop: dropout-based feature selection for scRNASeq.
Bioinformatics
; 35(16): 2865-2867, 2019 08 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30590489
17.
High-throughput functional comparison of promoter and enhancer activities.
Genome Res
; 26(8): 1023-33, 2016 08.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-27311442
18.
MPRAnator: a web-based tool for the design of massively parallel reporter assay experiments.
Bioinformatics
; 33(1): 137-138, 2017 01 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-27605100
19.
f-divergence cutoff index to simultaneously identify differential expression in the integrated transcriptome and proteome.
Nucleic Acids Res
; 44(10): e97, 2016 06 02.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-26980280
20.
Supervised clustering for single-cell analysis.
Nat Methods
; 16(10): 965-966, 2019 10.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31501544