Detalles de la búsqueda
1.
Total free energy analysis of fully hydrated proteins.
Proteins
; 91(1): 74-90, 2023 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35964252
2.
Energy-entropy multiscale cell correlation method to predict toluene-water log P in the SAMPL9 challenge.
Phys Chem Chem Phys
; 25(40): 27524-27531, 2023 Oct 18.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37800345
3.
What Determines the Selectivity of Arginine Dihydroxylation by the Nonheme Iron Enzyme OrfP?
Chemistry
; 27(5): 1795-1809, 2021 Jan 21.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32965733
4.
Energy-entropy prediction of octanol-water logP of SAMPL7 N-acyl sulfonamide bioisosters.
J Comput Aided Mol Des
; 35(7): 831-840, 2021 07.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34244906
5.
Energy-entropy method using multiscale cell correlation to calculate binding free energies in the SAMPL8 host-guest challenge.
J Comput Aided Mol Des
; 35(8): 911-921, 2021 08.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34264476
6.
Convergence behaviour of solvation shells in simulated liquids.
Phys Chem Chem Phys
; 23(8): 4892-4900, 2021 Mar 04.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33616583
7.
How Do Electrostatic Perturbations of the Protein Affect the Bifurcation Pathways of Substrate Hydroxylation versus Desaturation in the Nonheme Iron-Dependent Viomycin Biosynthesis Enzyme?
J Phys Chem A
; 125(8): 1720-1737, 2021 Mar 04.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33620220
8.
Lignin Biodegradation by a Cytochrome P450 Enzyme: A Computational Study into Syringol Activation by GcoA.
Chemistry
; 26(57): 13093-13102, 2020 Oct 09.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32613677
9.
Model for Counterion Binding and Charge Reversal on Protein Surfaces.
Mol Pharm
; 17(2): 595-603, 2020 02 03.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31887056
10.
Cross-linking of aromatic phenolate groups by cytochrome P450 enzymes: a model for the biosynthesis of vancomycin by OxyB.
Org Biomol Chem
; 18(24): 4610-4618, 2020 06 24.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32515757
11.
Entropy of Proteins Using Multiscale Cell Correlation.
J Chem Inf Model
; 60(11): 5540-5551, 2020 11 23.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32955869
12.
Extending the Martini Coarse-Grained Force Field to N-Glycans.
J Chem Inf Model
; 60(8): 3864-3883, 2020 08 24.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32702979
13.
Entropy of Simulated Liquids Using Multiscale Cell Correlation.
Entropy (Basel)
; 21(8)2019 Jul 31.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33267464
14.
Overcoming the limitations of cutoffs for defining atomic coordination in multicomponent systems.
J Comput Chem
; 39(12): 705-710, 2018 May 05.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29243263
15.
Protons and Hydroxide Ions in Aqueous Systems.
Chem Rev
; 116(13): 7642-72, 2016 07 13.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-27314430
16.
Water Determines the Structure and Dynamics of Proteins.
Chem Rev
; 116(13): 7673-97, 2016 07 13.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-27186992
17.
Locally adaptive method to define coordination shell.
J Chem Phys
; 145(8): 084108, 2016 Aug 28.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-27586905
18.
Instantaneous, parameter-free methods to define a solute's hydration shell.
J Chem Phys
; 143(23): 234501, 2015 Dec 21.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-26696060
19.
Water-The Most Anomalous Liquid.
Chem Rev
; 116(13): 7459-62, 2016 Jul 13.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-27405667
20.
Long-range hydrogen-bond structure in aqueous solutions and the vapor-water interface.
J Chem Phys
; 137(3): 034508, 2012 Jul 21.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-22830712