Detalles de la búsqueda
1.
ProBiS-Fold Approach for Annotation of Human Structures from the AlphaFold Database with No Corresponding Structure in the PDB to Discover New Druggable Binding Sites.
J Chem Inf Model
; 62(22): 5821-5829, 2022 11 28.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36269348
2.
ProBiS-Dock: A Hybrid Multitemplate Homology Flexible Docking Algorithm Enabled by Protein Binding Site Comparison.
J Chem Inf Model
; 62(6): 1573-1584, 2022 03 28.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35289616
3.
ProBiS-Dock Database: A Web Server and Interactive Web Repository of Small Ligand-Protein Binding Sites for Drug Design.
J Chem Inf Model
; 61(8): 4097-4107, 2021 08 23.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34319727
4.
Potential Novel Thioether-Amide or Guanidine-Linker Class of SARS-CoV-2 Virus RNA-Dependent RNA Polymerase Inhibitors Identified by High-Throughput Virtual Screening Coupled to Free-Energy Calculations.
Int J Mol Sci
; 22(20)2021 Oct 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34681802
5.
Ensemble Docking Coupled to Linear Interaction Energy Calculations for Identification of Coronavirus Main Protease (3CLpro) Non-Covalent Small-Molecule Inhibitors.
Molecules
; 25(24)2020 Dec 09.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33316996
6.
Discovery of Novel Potential Human Targets of Resveratrol by Inverse Molecular Docking.
J Chem Inf Model
; 59(5): 2467-2478, 2019 05 28.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30883115
7.
GenProBiS: web server for mapping of sequence variants to protein binding sites.
Nucleic Acids Res
; 45(W1): W253-W259, 2017 07 03.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28498966
8.
Discovery of new MurA inhibitors using induced-fit simulation and docking.
Bioorg Med Chem Lett
; 27(4): 944-949, 2017 02 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28077258
9.
Identification of Conserved Water Sites in Protein Structures for Drug Design.
J Chem Inf Model
; 57(12): 3094-3103, 2017 12 26.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29155577
10.
H274Y's Effect on Oseltamivir Resistance: What Happens Before the Drug Enters the Binding Site.
J Chem Inf Model
; 56(1): 82-100, 2016 Jan 25.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-26703840
11.
ProBiS-ligands: a web server for prediction of ligands by examination of protein binding sites.
Nucleic Acids Res
; 42(Web Server issue): W215-20, 2014 Jul.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-24861616
12.
Nonpeptidic Selective Inhibitors of the Chymotrypsin-Like (ß5 i) Subunit of the Immunoproteasome.
Angew Chem Int Ed Engl
; 55(19): 5745-8, 2016 05 04.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-27037901
13.
ProBiS-CHARMMing: Web Interface for Prediction and Optimization of Ligands in Protein Binding Sites.
J Chem Inf Model
; 55(11): 2308-14, 2015 Nov 23.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-26509288
14.
LiSiCA: A Software for Ligand-Based Virtual Screening and Its Application for the Discovery of Butyrylcholinesterase Inhibitors.
J Chem Inf Model
; 55(8): 1521-8, 2015 Aug 24.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-26158767
15.
Molecular dynamics to enhance structure-based virtual screening on cathepsin B.
J Comput Aided Mol Des
; 29(8): 707-12, 2015 Aug.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-25947277
16.
Structure-based function prediction of uncharacterized protein using binding sites comparison.
PLoS Comput Biol
; 9(11): e1003341, 2013.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-24244144
17.
ProBiS-2012: web server and web services for detection of structurally similar binding sites in proteins.
Nucleic Acids Res
; 40(Web Server issue): W214-21, 2012 Jul.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-22600737
18.
An exact algorithm to find a maximum weight clique in a weighted undirected graph.
Sci Rep
; 14(1): 9118, 2024 Apr 20.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38643335
19.
Exact parallel maximum clique algorithm for general and protein graphs.
J Chem Inf Model
; 53(9): 2217-28, 2013 Sep 23.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-23965016
20.
Structurally conserved binding sites of hemagglutinin as targets for influenza drug and vaccine development.
J Chem Inf Model
; 53(9): 2423-36, 2013 Sep 23.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-23980878