Detalles de la búsqueda
1.
The LightDock Server: Artificial Intelligence-powered modeling of macromolecular interactions.
Nucleic Acids Res
; 51(W1): W298-W304, 2023 07 05.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37140054
2.
Discriminating physiological from non-physiological interfaces in structures of protein complexes: A community-wide study.
Proteomics
; 23(17): e2200323, 2023 09.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37365936
3.
Impact of AlphaFold on structure prediction of protein complexes: The CASP15-CAPRI experiment.
Proteins
; 91(12): 1658-1683, 2023 Dec.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37905971
4.
UDock2: interactive real-time multi-body protein-protein docking software.
Bioinformatics
; 39(10)2022 Jan 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37792496
5.
Rational Prediction of PROTAC-Compatible Protein-Protein Interfaces by Molecular Docking.
J Chem Inf Model
; 63(21): 6823-6833, 2023 11 13.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37877240
6.
PDB-tools web: A user-friendly interface for the manipulation of PDB files.
Proteins
; 89(3): 330-335, 2021 03.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33111403
7.
Prediction of protein assemblies, the next frontier: The CASP14-CAPRI experiment.
Proteins
; 89(12): 1800-1823, 2021 12.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34453465
8.
LightDock goes information-driven.
Bioinformatics
; 36(3): 950-952, 2020 02 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31418773
9.
pyDockEneRes: per-residue decomposition of protein-protein docking energy.
Bioinformatics
; 36(7): 2284-2285, 2020 04 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31808797
10.
proABC-2: PRediction of AntiBody contacts v2 and its application to information-driven docking.
Bioinformatics
; 36(20): 5107-5108, 2020 12 22.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32683441
11.
Integrative modeling of protein-protein interactions with pyDock for the new docking challenges.
Proteins
; 88(8): 999-1008, 2020 08.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31746039
12.
SKEMPI 2.0: an updated benchmark of changes in protein-protein binding energy, kinetics and thermodynamics upon mutation.
Bioinformatics
; 35(3): 462-469, 2019 02 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30020414
13.
PRODIGY-crystal: a web-tool for classification of biological interfaces in protein complexes.
Bioinformatics
; 35(22): 4821-4823, 2019 11 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31141126
14.
LightDock: a new multi-scale approach to protein-protein docking.
Bioinformatics
; 34(1): 49-55, 2018 01 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28968719
15.
IRaPPA: information retrieval based integration of biophysical models for protein assembly selection.
Bioinformatics
; 33(12): 1806-1813, 2017 Jun 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28200016
16.
pyDock scoring for the new modeling challenges in docking: Protein-peptide, homo-multimers, and domain-domain interactions.
Proteins
; 85(3): 487-496, 2017 03.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-27701776
17.
pyDockSAXS: protein-protein complex structure by SAXS and computational docking.
Nucleic Acids Res
; 43(W1): W356-61, 2015 Jul 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-25897115
18.
CCharPPI web server: computational characterization of protein-protein interactions from structure.
Bioinformatics
; 31(1): 123-5, 2015 Jan 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-25183488
19.
Blind prediction of interfacial water positions in CAPRI.
Proteins
; 82(4): 620-32, 2014 Apr.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-24155158
20.
pyDockWEB: a web server for rigid-body protein-protein docking using electrostatics and desolvation scoring.
Bioinformatics
; 29(13): 1698-9, 2013 Jul 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-23661696