Detalles de la búsqueda
1.
Automated model building and protein identification in cryo-EM maps.
Nature
; 628(8007): 450-457, 2024 Apr.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38408488
2.
Spatial landmark detection and tissue registration with deep learning.
Nat Methods
; 21(4): 673-679, 2024 Apr.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38438615
3.
Pathway analysis through mutual information.
Bioinformatics
; 40(1)2024 01 02.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38195928
4.
Triqler for Protein Summarization of Data from Data-Independent Acquisition Mass Spectrometry.
J Proteome Res
; 22(4): 1359-1366, 2023 04 07.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36988210
5.
Retention Time and Fragmentation Predictors Increase Confidence in Identification of Common Variant Peptides.
J Proteome Res
; 22(10): 3190-3199, 2023 Oct 06.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37656829
6.
Toward an Integrated Machine Learning Model of a Proteomics Experiment.
J Proteome Res
; 22(3): 681-696, 2023 03 03.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36744821
7.
Survival analysis of pathway activity as a prognostic determinant in breast cancer.
PLoS Comput Biol
; 18(3): e1010020, 2022 03.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35344554
8.
Prosit Transformer: A transformer for Prediction of MS2 Spectrum Intensities.
J Proteome Res
; 21(5): 1359-1364, 2022 05 06.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35413196
9.
Interpretation of the DOME Recommendations for Machine Learning in Proteomics and Metabolomics.
J Proteome Res
; 21(4): 1204-1207, 2022 04 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35119864
10.
A Comprehensive Evaluation of Consensus Spectrum Generation Methods in Proteomics.
J Proteome Res
; 21(6): 1566-1574, 2022 06 03.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35549218
11.
Putting Humpty Dumpty Back Together Again: What Does Protein Quantification Mean in Bottom-Up Proteomics?
J Proteome Res
; 21(4): 891-898, 2022 04 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35220718
12.
Parallelized calculation of permutation tests.
Bioinformatics
; 36(22-23): 5392-5397, 2021 04 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33289531
13.
Triqler for MaxQuant: Enhancing Results from MaxQuant by Bayesian Error Propagation and Integration.
J Proteome Res
; 20(4): 2062-2068, 2021 04 02.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33661646
14.
Performing Selection on a Monotonic Function in Lieu of Sorting Using Layer-Ordered Heaps.
J Proteome Res
; 20(4): 1849-1854, 2021 04 02.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33529032
15.
Integrated Identification and Quantification Error Probabilities for Shotgun Proteomics.
Mol Cell Proteomics
; 18(3): 561-570, 2019 03.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30482846
16.
CoExpresso: assess the quantitative behavior of protein complexes in human cells.
BMC Bioinformatics
; 20(1): 17, 2019 Jan 09.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30626316
17.
Speeding Up Percolator.
J Proteome Res
; 18(9): 3353-3359, 2019 09 06.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31407580
18.
Covariation of Peptide Abundances Accurately Reflects Protein Concentration Differences.
Mol Cell Proteomics
; 16(5): 936-948, 2017 05.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28302922
19.
Response to "Comparison and Evaluation of Clustering Algorithms for Tandem Mass Spectra".
J Proteome Res
; 17(5): 1993-1996, 2018 05 04.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29682973
20.
A Protein Standard That Emulates Homology for the Characterization of Protein Inference Algorithms.
J Proteome Res
; 17(5): 1879-1886, 2018 05 04.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29631402