Detalles de la búsqueda
1.
Unraveling the functional dark matter through global metagenomics.
Nature
; 622(7983): 594-602, 2023 Oct.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37821698
2.
NMPFamsDB: a database of novel protein families from microbial metagenomes and metatranscriptomes.
Nucleic Acids Res
; 52(D1): D502-D512, 2024 Jan 05.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37811892
3.
Flame (v2.0): advanced integration and interpretation of functional enrichment results from multiple sources.
Bioinformatics
; 39(8)2023 08 01.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-37540207
4.
Multi-omics data integration and network-based analysis drives a multiplex drug repurposing approach to a shortlist of candidate drugs against COVID-19.
Brief Bioinform
; 22(6)2021 11 05.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34009288
5.
Arena3Dweb: interactive 3D visualization of multilayered networks.
Nucleic Acids Res
; 49(W1): W36-W45, 2021 07 02.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33885790
6.
ChemBioServer 2.0: an advanced web server for filtering, clustering and networking of chemical compounds facilitating both drug discovery and repurposing.
Bioinformatics
; 36(8): 2602-2604, 2020 04 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31913451
7.
PathWalks: identifying pathway communities using a disease-related map of integrated information.
Bioinformatics
; 36(13): 4070-4079, 2020 07 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32369599
8.
Analyzing Gene Expression Profiles from Ataxia and Spasticity Phenotypes to Reveal Spastic Ataxia Related Pathways.
Int J Mol Sci
; 21(18)2020 Sep 14.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32937819
9.
Investigating the Transition of Pre-Symptomatic to Symptomatic Huntington's Disease Status Based on Omics Data.
Int J Mol Sci
; 21(19)2020 Oct 08.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33049985
10.
Visualizing metagenomic and metatranscriptomic data: A comprehensive review.
Comput Struct Biotechnol J
; 23: 2011-2033, 2024 Dec.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38765606
11.
Corrigendum: A guide to conquer the biological network era using graph theory.
Front Bioeng Biotechnol
; 11: 1182500, 2023.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37064232
12.
SCALA: A complete solution for multimodal analysis of single-cell Next Generation Sequencing data.
Comput Struct Biotechnol J
; 21: 5382-5393, 2023.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38022693
13.
Arena3Dweb: interactive 3D visualization of multilayered networks supporting multiple directional information channels, clustering analysis and application integration.
NAR Genom Bioinform
; 5(2): lqad053, 2023 Jun.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37260509
14.
Niclosamide Attenuates Inflammation-Associated Profibrotic Responses in Human Subepithelial Lung Myofibroblasts.
Biomedicines
; 11(7)2023 Jul 19.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37509671
15.
Exploring microbial functional biodiversity at the protein family level-From metagenomic sequence reads to annotated protein clusters.
Front Bioinform
; 3: 1157956, 2023.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36959975
16.
NORMA: The Network Makeup Artist - A Web Tool for Network Annotation Visualization.
Genomics Proteomics Bioinformatics
; 20(3): 578-586, 2022 06.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34171457
17.
The network makeup artist (NORMA-2.0): distinguishing annotated groups in a network using innovative layout strategies.
Bioinform Adv
; 2(1): vbac036, 2022.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-36699373
18.
Darling: A Web Application for Detecting Disease-Related Biomedical Entity Associations with Literature Mining.
Biomolecules
; 12(4)2022 03 30.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35454109
19.
Fibrotic expression profile analysis reveals repurposed drugs with potential anti-fibrotic mode of action.
PLoS One
; 16(4): e0249687, 2021.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-33826640
20.
VICTOR: A visual analytics web application for comparing cluster sets.
Comput Biol Med
; 135: 104557, 2021 08.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-34139436