Detalles de la búsqueda
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Transcriptional and epigenetic dynamics during specification of human embryonic stem cells.
Cell
; 153(5): 1149-63, 2013 May 23.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-23664763
2.
scBasset: sequence-based modeling of single-cell ATAC-seq using convolutional neural networks.
Nat Methods
; 19(9): 1088-1096, 2022 09.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35941239
3.
Semisupervised adversarial neural networks for single-cell classification.
Genome Res
; 31(10): 1781-1793, 2021 10.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33627475
4.
Effective gene expression prediction from sequence by integrating long-range interactions.
Nat Methods
; 18(10): 1196-1203, 2021 10.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34608324
5.
Predicting 3D genome folding from DNA sequence with Akita.
Nat Methods
; 17(11): 1111-1117, 2020 11.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33046897
6.
Murine single-cell RNA-seq reveals cell-identity- and tissue-specific trajectories of aging.
Genome Res
; 29(12): 2088-2103, 2019 12.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31754020
7.
Sequential regulatory activity prediction across chromosomes with convolutional neural networks.
Genome Res
; 28(5): 739-750, 2018 05.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29588361
8.
Author Correction: scBasset: sequence-based modeling of single-cell ATAC-seq using convolutional neural networks.
Nat Methods
; 20(1): 162, 2023 Jan.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36564580
9.
Cross-species regulatory sequence activity prediction.
PLoS Comput Biol
; 16(7): e1008050, 2020 07.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32687525
10.
Basset: learning the regulatory code of the accessible genome with deep convolutional neural networks.
Genome Res
; 26(7): 990-9, 2016 07.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-27197224
11.
Long noncoding RNAs regulate adipogenesis.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 110(9): 3387-92, 2013 Feb 26.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-23401553
12.
Assemblathon 1: a competitive assessment of de novo short read assembly methods.
Genome Res
; 21(12): 2224-41, 2011 Dec.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-21926179
13.
Gene prediction with Glimmer for metagenomic sequences augmented by classification and clustering.
Nucleic Acids Res
; 40(1): e9, 2012 Jan.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-22102569
14.
Rewriting regulatory DNA to dissect and reprogram gene expression.
bioRxiv
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Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38187584
15.
An encyclopedia of enhancer-gene regulatory interactions in the human genome.
bioRxiv
; 2023 Nov 13.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38014075
16.
The genetic and biochemical determinants of mRNA degradation rates in mammals.
Genome Biol
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Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36419176
17.
Novel insights from a multiomics dissection of the Hayflick limit.
Elife
; 112022 02 04.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35119359
18.
The landscape of alternative polyadenylation in single cells of the developing mouse embryo.
Nat Commun
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| MEDLINE | ID: mdl-34429411
19.
Differentiation reveals latent features of aging and an energy barrier in murine myogenesis.
Cell Rep
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Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-33910007
20.
Leveraging supervised learning for functionally informed fine-mapping of cis-eQTLs identifies an additional 20,913 putative causal eQTLs.
Nat Commun
; 12(1): 3394, 2021 06 07.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-34099641