Detalles de la búsqueda
1.
The effect of genome graph expressiveness on the discrepancy between genome graph distance and string set distance.
Bioinformatics
; 38(Suppl 1): i404-i412, 2022 06 24.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35758819
2.
Constructing small genome graphs via string compression.
Bioinformatics
; 37(Suppl_1): i205-i213, 2021 07 12.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34252955
3.
Practical selection of representative sets of RNA-seq samples using a hierarchical approach.
Bioinformatics
; 37(Suppl_1): i334-i341, 2021 07 12.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34252927
4.
Maximum likelihood reconstruction of ancestral networks by integer linear programming.
Bioinformatics
; 37(8): 1083-1092, 2021 05 23.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33135733
5.
Sequence-specific minimizers via polar sets.
Bioinformatics
; 37(Suppl_1): i187-i195, 2021 07 12.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34252928
6.
HARVESTMAN: a framework for hierarchical feature learning and selection from whole genome sequencing data.
BMC Bioinformatics
; 22(1): 174, 2021 Apr 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33794760
7.
Improved design and analysis of practical minimizers.
Bioinformatics
; 36(Suppl_1): i119-i127, 2020 07 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32657376
8.
Salmon provides fast and bias-aware quantification of transcript expression.
Nat Methods
; 14(4): 417-419, 2017 Apr.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28263959
9.
Locality-sensitive hashing for the edit distance.
Bioinformatics
; 35(14): i127-i135, 2019 07 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31510667
10.
Quantifying the similarity of topological domains across normal and cancer human cell types.
Bioinformatics
; 34(13): i475-i483, 2018 07 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29949963
11.
Asymptotically optimal minimizers schemes.
Bioinformatics
; 34(13): i13-i22, 2018 07 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29949995
12.
Using the Ribodeblur pipeline to recover A-sites from yeast ribosome profiling data.
Methods
; 137: 67-70, 2018 03 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29330118
13.
Chromosomal dynamics predicted by an elastic network model explains genome-wide accessibility and long-range couplings.
Nucleic Acids Res
; 45(7): 3663-3673, 2017 04 20.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28334818
14.
Improving the performance of minimizers and winnowing schemes.
Bioinformatics
; 33(14): i110-i117, 2017 Jul 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28881970
15.
Designing small universal k-mer hitting sets for improved analysis of high-throughput sequencing.
PLoS Comput Biol
; 13(10): e1005777, 2017 Oct.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28968408
16.
Isoform-level ribosome occupancy estimation guided by transcript abundance with Ribomap.
Bioinformatics
; 32(12): 1880-2, 2016 06 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-27153676
17.
Optimal seed solver: optimizing seed selection in read mapping.
Bioinformatics
; 32(11): 1632-42, 2016 06 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-26568624
18.
A computational method for designing diverse linear epitopes including citrullinated peptides with desired binding affinities to intravenous immunoglobulin.
BMC Bioinformatics
; 17: 155, 2016 Apr 08.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-27059896
19.
Data-dependent bucketing improves reference-free compression of sequencing reads.
Bioinformatics
; 31(17): 2770-7, 2015 Sep 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-25910696
20.
Reference-based compression of short-read sequences using path encoding.
Bioinformatics
; 31(12): 1920-8, 2015 Jun 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-25649622