Detalles de la búsqueda
1.
Quantitative Activity Profile and Context Dependence of All Human 5' Splice Sites.
Mol Cell
; 71(6): 1012-1026.e3, 2018 09 20.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30174293
2.
Higher-order epistasis and phenotypic prediction.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 119(39): e2204233119, 2022 09 27.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36129941
3.
Structural and mechanistic basis of σ-dependent transcriptional pausing.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 119(23): e2201301119, 2022 06 07.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35653571
4.
Field-theoretic density estimation for biological sequence space with applications to 5' splice site diversity and aneuploidy in cancer.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 118(40)2021 10 05.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34599093
5.
Promoter-sequence determinants and structural basis of primer-dependent transcription initiation in Escherichia coli.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 118(27)2021 07 06.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34187896
6.
Massively Parallel Assays and Quantitative Sequence-Function Relationships.
Annu Rev Genomics Hum Genet
; 20: 99-127, 2019 08 31.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31091417
7.
Logomaker: beautiful sequence logos in Python.
Bioinformatics
; 36(7): 2272-2274, 2020 04 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31821414
8.
Systematic approach for dissecting the molecular mechanisms of transcriptional regulation in bacteria.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 115(21): E4796-E4805, 2018 05 22.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29728462
9.
Mapping DNA sequence to transcription factor binding energy in vivo.
PLoS Comput Biol
; 15(2): e1006226, 2019 02.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30716072
10.
Concerted activities of Mcm4, Sld3, and Dbf4 in control of origin activation and DNA replication fork progression.
Genome Res
; 26(3): 315-30, 2016 Mar.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-26733669
11.
Density Estimation on Small Data Sets.
Phys Rev Lett
; 121(16): 160605, 2018 Oct 19.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30387642
12.
Equitability, mutual information, and the maximal information coefficient.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 111(9): 3354-9, 2014 Mar 04.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-24550517
13.
Domain within the helicase subunit Mcm4 integrates multiple kinase signals to control DNA replication initiation and fork progression.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 111(18): E1899-908, 2014 May 06.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-24740181
14.
Parametric inference in the large data limit using maximally informative models.
Neural Comput
; 26(4): 637-53, 2014 Apr.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-24479782
15.
Interpreting cis-regulatory mechanisms from genomic deep neural networks using surrogate models.
bioRxiv
; 2024 Mar 02.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38013993
16.
Specificity, synergy, and mechanisms of splice-modifying drugs.
Nat Commun
; 15(1): 1880, 2024 Feb 29.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38424098
17.
Using deep sequencing to characterize the biophysical mechanism of a transcriptional regulatory sequence.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 107(20): 9158-63, 2010 May 18.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-20439748
18.
Reply to Reshef et al.: Falsifiability or bust.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 111(33): E3364, 2014 Aug 19.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-25275168
19.
Reply to Murrell et al.: Noise matters.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 111(21): E2161, 2014 May 27.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-25035890
20.
MAVE-NN: learning genotype-phenotype maps from multiplex assays of variant effect.
Genome Biol
; 23(1): 98, 2022 04 15.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-35428271