Detalles de la búsqueda
1.
Topological data analysis reveals a core gene expression backbone that defines form and function across flowering plants.
PLoS Biol
; 21(12): e3002397, 2023 Dec.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38051702
2.
Joint representation of molecular networks from multiple species improves gene classification.
PLoS Comput Biol
; 20(1): e1011773, 2024 Jan.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-38198480
3.
Accurately modeling biased random walks on weighted networks using node2vec.
Bioinformatics
; 39(1)2023 01 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36688699
4.
PyGenePlexus: a Python package for gene discovery using network-based machine learning.
Bioinformatics
; 39(2)2023 02 03.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-36721325
5.
GenePlexus: a web-server for gene discovery using network-based machine learning.
Nucleic Acids Res
; 50(W1): W358-W366, 2022 07 05.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-35580053
6.
Functional assessment of the "two-hit" model for neurodevelopmental defects in Drosophila and X. laevis.
PLoS Genet
; 17(4): e1009112, 2021 04.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-33819264
7.
Reconciling multiple connectivity scores for drug repurposing.
Brief Bioinform
; 22(6)2021 11 05.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-34013329
8.
Linking Composition, Structure and Thickness of CoOOH layers to Oxygen Evolution Reaction Activity by Correlative Microscopy.
Angew Chem Int Ed Engl
; 62(28): e202305982, 2023 Jul 10.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-37178313
9.
PecanPy: a fast, efficient and parallelized Python implementation of node2vec.
Bioinformatics
; 37(19): 3377-3379, 2021 Oct 11.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33760066
10.
A flexible, interpretable, and accurate approach for imputing the expression of unmeasured genes.
Nucleic Acids Res
; 48(21): e125, 2020 12 02.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33074331
11.
Supervised learning is an accurate method for network-based gene classification.
Bioinformatics
; 36(11): 3457-3465, 2020 06 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32129827
12.
GIANT 2.0: genome-scale integrated analysis of gene networks in tissues.
Nucleic Acids Res
; 46(W1): W65-W70, 2018 07 02.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29800226
13.
Rare variants in the genetic background modulate cognitive and developmental phenotypes in individuals carrying disease-associated variants.
Genet Med
; 21(4): 816-825, 2019 04.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30190612
14.
A loop-counting method for covariate-corrected low-rank biclustering of gene-expression and genome-wide association study data.
PLoS Comput Biol
; 14(5): e1006105, 2018 05.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29758032
15.
Targeted exploration and analysis of large cross-platform human transcriptomic compendia.
Nat Methods
; 12(3): 211-4, 3 p following 214, 2015 Mar.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-25581801
16.
FNTM: a server for predicting functional networks of tissues in mouse.
Nucleic Acids Res
; 43(W1): W182-7, 2015 Jul 01.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-25940632
17.
IMP 2.0: a multi-species functional genomics portal for integration, visualization and prediction of protein functions and networks.
Nucleic Acids Res
; 43(W1): W128-33, 2015 Jul 01.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-25969450
18.
Tissue-aware data integration approach for the inference of pathway interactions in metazoan organisms.
Bioinformatics
; 31(7): 1093-101, 2015 Apr 01.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-25431329
19.
Rice GROWTH UNDER DROUGHT KINASE is required for drought tolerance and grain yield under normal and drought stress conditions.
Plant Physiol
; 166(3): 1634-45, 2014 Nov.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-25209982
20.
Low-variance RNAs identify Parkinson's disease molecular signature in blood.
Mov Disord
; 30(6): 813-21, 2015 May.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-25786808