Detalles de la búsqueda
1.
DOCK 6: Impact of new features and current docking performance.
J Comput Chem
; 36(15): 1132-56, 2015 Jun 05.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-25914306
2.
Darwinian docking.
J Comput Aided Mol Des
; 26(1): 73-5, 2012 Jan.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-22143893
3.
DOCK 6: combining techniques to model RNA-small molecule complexes.
RNA
; 15(6): 1219-30, 2009 Jun.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-19369428
4.
Assessment of the role of computations in structural biology.
Adv Protein Chem
; 66: 1-25, 2003.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-14631815
5.
Hierarchical database screenings for HIV-1 reverse transcriptase using a pharmacophore model, rigid docking, solvation docking, and MM-PB/SA.
J Med Chem
; 48(7): 2432-44, 2005 Apr 07.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-15801834
6.
Evaluating the high-throughput screening computations.
J Biomol Screen
; 10(7): 649-52, 2005 Oct.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-16170047
7.
Small molecule affinity fingerprinting. A tool for enzyme family subclassification, target identification, and inhibitor design.
Chem Biol
; 9(10): 1085-94, 2002 Oct.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-12401493
8.
Stability of macromolecular complexes.
Proteins
; 48(4): 645-53, 2002 Sep 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-12211032
9.
A molecular basis for the selectivity of thiadiazole urea inhibitors with stromelysin-1 and gelatinase-A from generalized born molecular dynamics simulations.
J Med Chem
; 47(12): 3065-74, 2004 Jun 03.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-15163188
10.
Investigation of neuraminidase-substrate recognition using molecular dynamics and free energy calculations.
J Med Chem
; 46(26): 5628-37, 2003 Dec 18.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-14667217
11.
Computer-assisted design of selective imidazole inhibitors for cytochrome p450 enzymes.
J Med Chem
; 47(14): 3572-9, 2004 Jul 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-15214784
12.
Molecular dynamics and free energy analyses of cathepsin D-inhibitor interactions: insight into structure-based ligand design.
J Med Chem
; 45(7): 1412-9, 2002 Mar 28.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-11906282
13.
Computational investigation of kinetics of cross-linking reactions in proteins: importance in structure prediction.
Biopolymers
; 91(1): 68-77, 2009 Jan.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-18781627
14.
Partial acetylation of lysine residues improves intraprotein cross-linking.
Anal Chem
; 80(4): 951-60, 2008 Feb 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-18201069
15.
The collaboratory for MS3D: a new cyberinfrastructure for the structural elucidation of biological macromolecules and their assemblies using mass spectrometry-based approaches.
J Proteome Res
; 7(11): 4848-57, 2008 Nov.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-18817429
16.
Rational design of a nonpeptide general chemical scaffold for reversible inhibition of PDZ domain interactions.
Bioorg Med Chem Lett
; 17(2): 549-52, 2007 Jan 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-17055267
17.
Estimation of Absolute Free Energies of Hydration Using Continuum Methods: Accuracy of Partial Charge Models and Optimization of Nonpolar Contributions.
J Chem Theory Comput
; 2(1): 128-39, 2006 Jan.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-26626387
18.
Development and validation of a modular, extensible docking program: DOCK 5.
J Comput Aided Mol Des
; 20(10-11): 601-19, 2006.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-17149653
19.
Proteomimetic libraries: design, synthesis, and evaluation of p53-MDM2 interaction inhibitors.
J Comb Chem
; 8(3): 315-25, 2006.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-16677000
20.
An information theoretic approach to macromolecular modeling: I. Sequence alignments.
Biophys J
; 89(5): 2998-3007, 2005 Nov.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-16254389