Detalles de la búsqueda
1.
Loss of copy numbers of retrotransposons (HERVK) on chromosome 7p11.2 impacts EGFR (Epidermal Growth Factor Receptor)-induced phenotypes for platinum sensitivity and long-term survival in ovarian cancer-A study from the OVCAD consortium.
Int J Cancer
; 2024 May 06.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38709956
2.
TDP-43 enhances translation of specific mRNAs linked to neurodegenerative disease.
Nucleic Acids Res
; 47(1): 341-361, 2019 01 10.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30357366
3.
GfaViz: flexible and interactive visualization of GFA sequence graphs.
Bioinformatics
; 35(16): 2853-2855, 2019 08 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30596893
4.
GfaPy: a flexible and extensible software library for handling sequence graphs in Python.
Bioinformatics
; 33(19): 3094-3095, 2017 Oct 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28645150
5.
Handling temperature bursts reaching 464°C: different microbial strategies in the sisters peak hydrothermal chimney.
Appl Environ Microbiol
; 80(15): 4585-98, 2014 Aug.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-24837379
6.
Recurrent deletion of 3p13 targets multiple tumour suppressor genes and defines a distinct subgroup of aggressive ERG fusion-positive prostate cancers.
J Pathol
; 231(1): 130-41, 2013 Sep.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-23794398
7.
Fast online and index-based algorithms for approximate search of RNA sequence-structure patterns.
BMC Bioinformatics
; 14: 226, 2013 Jul 17.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-23865810
8.
In situ chemistry and microbial community compositions in five deep-sea hydrothermal fluid samples from Irina II in the Logatchev field.
Environ Microbiol
; 15(5): 1551-60, 2013 May.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-23171403
9.
Genomic deletion of PTEN is associated with tumor progression and early PSA recurrence in ERG fusion-positive and fusion-negative prostate cancer.
Am J Pathol
; 181(2): 401-12, 2012 Aug.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-22705054
10.
Readjoiner: a fast and memory efficient string graph-based sequence assembler.
BMC Bioinformatics
; 13: 82, 2012 May 06.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-22559072
11.
Structator: fast index-based search for RNA sequence-structure patterns.
BMC Bioinformatics
; 12: 214, 2011 May 27.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-21619640
12.
Fine-grained annotation and classification of de novo predicted LTR retrotransposons.
Nucleic Acids Res
; 37(21): 7002-13, 2009 Nov.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-19786494
13.
PPFIA1 and CCND1 are frequently coamplified in breast cancer.
Genes Chromosomes Cancer
; 49(1): 1-8, 2010 Jan.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-19787783
14.
DeepGRP: engineering a software tool for predicting genomic repetitive elements using Recurrent Neural Networks with attention.
Algorithms Mol Biol
; 16(1): 20, 2021 Aug 23.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34425870
15.
Sequencing, annotation, and comparative genome analysis of the gerbil-adapted Helicobacter pylori strain B8.
BMC Genomics
; 11: 335, 2010 May 27.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-20507619
16.
Significant speedup of database searches with HMMs by search space reduction with PSSM family models.
Bioinformatics
; 25(24): 3251-8, 2009 Dec 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-19828575
17.
AnnotationSketch: a genome annotation drawing library.
Bioinformatics
; 25(4): 533-4, 2009 Feb 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-19106120
18.
Selective regain of egfr gene copies in CD44+/CD24-/low breast cancer cellular model MDA-MB-468.
BMC Cancer
; 10: 78, 2010 Mar 03.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-20199686
19.
Fast mapping of short sequences with mismatches, insertions and deletions using index structures.
PLoS Comput Biol
; 5(9): e1000502, 2009 Sep.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-19750212
20.
Parameters Governing the Community Structure and Element Turnover in Kermadec Volcanic Ash and Hydrothermal Fluids as Monitored by Inorganic Electron Donor Consumption, Autotrophic CO2 Fixation and 16S Tags of the Transcriptome in Incubation Experiments.
Front Microbiol
; 10: 2296, 2019.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31649639